Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NTRK3Q16288 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NTRK3Q16288 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NTRK3Q16288 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NTRK3Q16288 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NTRK3Q16288 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NTRK3Q16288 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NTRK3Q16288 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NTRK3Q16288 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NTRK3Q16288 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NTRK3Q16288 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NTRK3Q16288 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NTRK3Q16288 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NTRK3Q16288 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NTRK3Q16288 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NTRK3Q16288 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NTRK3Q16288 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NTRK3Q16288 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NTRK3Q16288 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NTRK3Q16288 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NTRK3Q16288 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NTRK3Q16288 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NTRK3Q16288 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NTRK3Q16288 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NTRK3Q16288 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NTRK3Q16288 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NTRK3Q16288 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NTRK3Q16288 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NTRK3Q16288 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NTRK3Q16288 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NTRK3Q16288 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NTRK3Q16288 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NTRK3Q16288 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NTRK3Q16288 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NTRK3Q16288 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NTRK3Q16288 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NTRK3Q16288 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NTRK3Q16288 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NTRK3Q16288 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NTRK3Q16288 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NTRK3Q16288 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NTRK3Q16288 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NTRK3Q16288 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NTRK3Q16288 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NTRK3Q16288 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NTRK3Q16288 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NTRK3Q16288 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NTRK3Q16288 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NTRK3Q16288 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NTRK3Q16288 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NTRK3Q16288 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NTRK3Q16288 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NTRK3Q16288 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NTRK3Q16288 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NTRK3Q16288 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NTRK3Q16288 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NTRK3Q16288 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NTRK3Q16288 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NTRK3Q16288 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NTRK3Q16288 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NTRK3Q16288 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NTRK3Q16288 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NTRK3Q16288 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NTRK3Q16288 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NTRK3Q16288 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NTRK3Q16288 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NTRK3Q16288 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NTRK3Q16288 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NTRK3Q16288 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NTRK3Q16288 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NTRK3Q16288 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NTRK3Q16288 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NTRK3Q16288 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
NTRK3Q16288 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NTRK3Q16288 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NTRK3Q16288 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NTRK3Q16288 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NTRK3Q16288 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NTRK3Q16288 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NTRK3Q16288 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NTRK3Q16288 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NTRK3Q16288 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NTRK3Q16288 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NTRK3Q16288 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NTRK3Q16288 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NTRK3Q16288 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NTRK3Q16288 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NTRK3Q16288 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NTRK3Q16288 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NTRK3Q16288 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NTRK3Q16288 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NTRK3Q16288 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NTRK3Q16288 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NTRK3Q16288 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NTRK3Q16288 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NTRK3Q16288 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NTRK3Q16288 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NTRK3Q16288 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NTRK3Q16288 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NTRK3Q16288 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
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