Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB35Q15286 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB35Q15286 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB35Q15286 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB35Q15286 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB35Q15286 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB35Q15286 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB35Q15286 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB35Q15286 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB35Q15286 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB35Q15286 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB35Q15286 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB35Q15286 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB35Q15286 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB35Q15286 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB35Q15286 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB35Q15286 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB35Q15286 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB35Q15286 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB35Q15286 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB35Q15286 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB35Q15286 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB35Q15286 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB35Q15286 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB35Q15286 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB35Q15286 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB35Q15286 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB35Q15286 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB35Q15286 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB35Q15286 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB35Q15286 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB35Q15286 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB35Q15286 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
RAB35Q15286 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB35Q15286 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB35Q15286 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB35Q15286 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB35Q15286 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB35Q15286 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB35Q15286 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB35Q15286 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB35Q15286 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB35Q15286 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB35Q15286 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB35Q15286 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB35Q15286 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB35Q15286 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB35Q15286 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB35Q15286 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB35Q15286 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB35Q15286 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB35Q15286 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB35Q15286 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB35Q15286 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB35Q15286 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB35Q15286 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB35Q15286 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB35Q15286 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB35Q15286 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB35Q15286 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB35Q15286 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB35Q15286 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB35Q15286 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB35Q15286 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB35Q15286 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB35Q15286 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB35Q15286 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB35Q15286 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB35Q15286 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB35Q15286 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB35Q15286 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB35Q15286 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB35Q15286 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB35Q15286 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB35Q15286 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB35Q15286 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB35Q15286 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB35Q15286 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB35Q15286 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB35Q15286 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB35Q15286 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB35Q15286 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB35Q15286 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB35Q15286 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB35Q15286 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB35Q15286 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB35Q15286 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB35Q15286 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB35Q15286 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB35Q15286 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB35Q15286 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB35Q15286 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB35Q15286 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB35Q15286 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB35Q15286 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB35Q15286 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB35Q15286 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB35Q15286 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB35Q15286 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB35Q15286 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms