Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SHPRHQ149N8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SHPRHQ149N8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SHPRHQ149N8 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SHPRHQ149N8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SHPRHQ149N8 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SHPRHQ149N8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SHPRHQ149N8 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SHPRHQ149N8 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SHPRHQ149N8 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SHPRHQ149N8 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SHPRHQ149N8 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
SHPRHQ149N8 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SHPRHQ149N8 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SHPRHQ149N8 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SHPRHQ149N8 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SHPRHQ149N8 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SHPRHQ149N8 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SHPRHQ149N8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SHPRHQ149N8 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SHPRHQ149N8 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SHPRHQ149N8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SHPRHQ149N8 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SHPRHQ149N8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SHPRHQ149N8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SHPRHQ149N8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SHPRHQ149N8 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SHPRHQ149N8 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SHPRHQ149N8 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SHPRHQ149N8 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SHPRHQ149N8 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
SHPRHQ149N8 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SHPRHQ149N8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SHPRHQ149N8 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
SHPRHQ149N8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
SHPRHQ149N8 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SHPRHQ149N8 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SHPRHQ149N8 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SHPRHQ149N8 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SHPRHQ149N8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SHPRHQ149N8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SHPRHQ149N8 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SHPRHQ149N8 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SHPRHQ149N8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SHPRHQ149N8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SHPRHQ149N8 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SHPRHQ149N8 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
SHPRHQ149N8 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SHPRHQ149N8 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SHPRHQ149N8 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
SHPRHQ149N8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SHPRHQ149N8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SHPRHQ149N8 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SHPRHQ149N8 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SHPRHQ149N8 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SHPRHQ149N8 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SHPRHQ149N8 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SHPRHQ149N8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SHPRHQ149N8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
SHPRHQ149N8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SHPRHQ149N8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SHPRHQ149N8 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SHPRHQ149N8 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SHPRHQ149N8 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SHPRHQ149N8 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SHPRHQ149N8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SHPRHQ149N8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SHPRHQ149N8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SHPRHQ149N8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.37
SHPRHQ149N8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
SHPRHQ149N8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
SHPRHQ149N8 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
SHPRHQ149N8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SHPRHQ149N8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SHPRHQ149N8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SHPRHQ149N8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SHPRHQ149N8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SHPRHQ149N8 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SHPRHQ149N8 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SHPRHQ149N8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SHPRHQ149N8 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SHPRHQ149N8 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SHPRHQ149N8 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SHPRHQ149N8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SHPRHQ149N8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SHPRHQ149N8 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SHPRHQ149N8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SHPRHQ149N8 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SHPRHQ149N8 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
SHPRHQ149N8 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SHPRHQ149N8 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
SHPRHQ149N8 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
SHPRHQ149N8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SHPRHQ149N8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SHPRHQ149N8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SHPRHQ149N8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SHPRHQ149N8 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SHPRHQ149N8 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SHPRHQ149N8 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SHPRHQ149N8 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
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