Protein–RNA interactions for Protein: Q14684

RRP1B, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 758 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1BQ14684 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RRP1BQ14684 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RRP1BQ14684 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RRP1BQ14684 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RRP1BQ14684 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RRP1BQ14684 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RRP1BQ14684 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RRP1BQ14684 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RRP1BQ14684 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RRP1BQ14684 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RRP1BQ14684 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RRP1BQ14684 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RRP1BQ14684 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RRP1BQ14684 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RRP1BQ14684 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RRP1BQ14684 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RRP1BQ14684 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RRP1BQ14684 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RRP1BQ14684 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RRP1BQ14684 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RRP1BQ14684 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RRP1BQ14684 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RRP1BQ14684 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RRP1BQ14684 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RRP1BQ14684 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RRP1BQ14684 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RRP1BQ14684 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRP1BQ14684 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRP1BQ14684 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRP1BQ14684 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRP1BQ14684 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRP1BQ14684 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RRP1BQ14684 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRP1BQ14684 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRP1BQ14684 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRP1BQ14684 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRP1BQ14684 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRP1BQ14684 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRP1BQ14684 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RRP1BQ14684 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRP1BQ14684 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRP1BQ14684 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRP1BQ14684 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRP1BQ14684 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRP1BQ14684 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RRP1BQ14684 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RRP1BQ14684 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RRP1BQ14684 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RRP1BQ14684 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RRP1BQ14684 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RRP1BQ14684 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RRP1BQ14684 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RRP1BQ14684 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RRP1BQ14684 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RRP1BQ14684 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RRP1BQ14684 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RRP1BQ14684 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RRP1BQ14684 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RRP1BQ14684 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RRP1BQ14684 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RRP1BQ14684 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RRP1BQ14684 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RRP1BQ14684 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRP1BQ14684 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRP1BQ14684 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRP1BQ14684 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRP1BQ14684 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRP1BQ14684 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRP1BQ14684 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRP1BQ14684 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRP1BQ14684 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRP1BQ14684 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRP1BQ14684 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RRP1BQ14684 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RRP1BQ14684 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRP1BQ14684 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RRP1BQ14684 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRP1BQ14684 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RRP1BQ14684 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RRP1BQ14684 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RRP1BQ14684 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RRP1BQ14684 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RRP1BQ14684 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RRP1BQ14684 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RRP1BQ14684 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RRP1BQ14684 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RRP1BQ14684 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RRP1BQ14684 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RRP1BQ14684 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RRP1BQ14684 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RRP1BQ14684 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RRP1BQ14684 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RRP1BQ14684 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RRP1BQ14684 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RRP1BQ14684 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RRP1BQ14684 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RRP1BQ14684 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RRP1BQ14684 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RRP1BQ14684 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RRP1BQ14684 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
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