Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ALCAMQ13740 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ALCAMQ13740 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ALCAMQ13740 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
ALCAMQ13740 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ALCAMQ13740 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ALCAMQ13740 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ALCAMQ13740 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ALCAMQ13740 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ALCAMQ13740 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ALCAMQ13740 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ALCAMQ13740 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ALCAMQ13740 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ALCAMQ13740 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ALCAMQ13740 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ALCAMQ13740 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ALCAMQ13740 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ALCAMQ13740 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ALCAMQ13740 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ALCAMQ13740 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ALCAMQ13740 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ALCAMQ13740 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ALCAMQ13740 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ALCAMQ13740 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ALCAMQ13740 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ALCAMQ13740 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ALCAMQ13740 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ALCAMQ13740 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ALCAMQ13740 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ALCAMQ13740 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALCAMQ13740 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALCAMQ13740 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALCAMQ13740 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALCAMQ13740 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ALCAMQ13740 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALCAMQ13740 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ALCAMQ13740 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALCAMQ13740 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALCAMQ13740 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ALCAMQ13740 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALCAMQ13740 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALCAMQ13740 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALCAMQ13740 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALCAMQ13740 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALCAMQ13740 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALCAMQ13740 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALCAMQ13740 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALCAMQ13740 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALCAMQ13740 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALCAMQ13740 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALCAMQ13740 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALCAMQ13740 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALCAMQ13740 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALCAMQ13740 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALCAMQ13740 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALCAMQ13740 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALCAMQ13740 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALCAMQ13740 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALCAMQ13740 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALCAMQ13740 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ALCAMQ13740 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ALCAMQ13740 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ALCAMQ13740 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ALCAMQ13740 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ALCAMQ13740 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ALCAMQ13740 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ALCAMQ13740 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ALCAMQ13740 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ALCAMQ13740 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ALCAMQ13740 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ALCAMQ13740 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ALCAMQ13740 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ALCAMQ13740 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ALCAMQ13740 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ALCAMQ13740 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALCAMQ13740 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALCAMQ13740 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALCAMQ13740 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALCAMQ13740 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALCAMQ13740 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALCAMQ13740 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALCAMQ13740 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALCAMQ13740 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALCAMQ13740 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALCAMQ13740 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALCAMQ13740 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALCAMQ13740 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALCAMQ13740 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALCAMQ13740 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALCAMQ13740 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALCAMQ13740 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ALCAMQ13740 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ALCAMQ13740 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ALCAMQ13740 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ALCAMQ13740 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ALCAMQ13740 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ALCAMQ13740 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ALCAMQ13740 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ALCAMQ13740 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ALCAMQ13740 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
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