Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATP1A4Q13733 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATP1A4Q13733 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATP1A4Q13733 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATP1A4Q13733 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATP1A4Q13733 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATP1A4Q13733 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
ATP1A4Q13733 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATP1A4Q13733 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATP1A4Q13733 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATP1A4Q13733 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATP1A4Q13733 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
ATP1A4Q13733 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATP1A4Q13733 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATP1A4Q13733 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATP1A4Q13733 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATP1A4Q13733 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATP1A4Q13733 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATP1A4Q13733 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATP1A4Q13733 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATP1A4Q13733 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATP1A4Q13733 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATP1A4Q13733 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATP1A4Q13733 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
ATP1A4Q13733 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATP1A4Q13733 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATP1A4Q13733 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATP1A4Q13733 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATP1A4Q13733 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATP1A4Q13733 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATP1A4Q13733 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
ATP1A4Q13733 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
ATP1A4Q13733 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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