Protein–RNA interactions for Protein: Q13595

TRA2A, Transformer-2 protein homolog alpha, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRA2AQ13595 YWHAB-201ENST00000353703 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.655e-6■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 BAZ2A-210ENST00000549787 2773 ntTSL 1 (best)10.96□□□□□ -0.655e-6■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 ARID1B-225ENST00000637532 445 ntTSL 510.96□□□□□ -0.655e-6■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 YWHAB-206ENST00000479421 1097 ntTSL 510.86□□□□□ -0.675e-6■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 YWHAB-202ENST00000372839 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.745e-6■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 THOC5-206ENST00000418021 738 ntTSL 310.28□□□□□ -0.765e-6■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 ADNP-203ENST00000396029 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.785e-6■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 DKC1-206ENST00000452771 708 ntTSL 59.56□□□□□ -0.885e-6■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 PTPN12-216ENST00000523952 500 ntTSL 49.39□□□□□ -0.915e-6■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 DKC1-207ENST00000473552 656 ntTSL 29.39□□□□□ -0.915e-6■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 RBM26-201ENST00000267229 3624 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.915e-6■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 HNRNPC-220ENST00000555585 682 ntTSL 29.11□□□□□ -0.951e-7■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 DKC1-205ENST00000437719 686 ntTSL 38.96□□□□□ -0.985e-6■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 RAB3GAP1-201ENST00000264158 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.015e-6■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 ADNP-204ENST00000396032 4581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.075e-6■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 ADNP-206ENST00000621696 6224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.095e-6■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 ARID1B-218ENST00000636748 8853 ntTSL 28.2□□□□□ -1.15e-6■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 RAB3GAP1-203ENST00000442034 4185 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.125e-6■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 YWHAB-208ENST00000633979 689 ntTSL 37.78□□□□□ -1.165e-6■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 ARID1B-235ENST00000638000 1401 ntTSL 57.78□□□□□ -1.165e-6■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 DKC1-203ENST00000413910 851 ntTSL 57.64□□□□□ -1.195e-6■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 ARID1B-205ENST00000414678 6528 ntAPPRIS ALT2 TSL 57.59□□□□□ -1.195e-6■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 GFPT1-201ENST00000357308 8703 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.245e-6■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 HNRNPC-210ENST00000554417 691 ntTSL 27.12□□□□□ -1.271e-7■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 BCLAF1-223ENST00000628517 2512 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.272e-12■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 GFPT1-204ENST00000494201 625 ntTSL 57.03□□□□□ -1.285e-6■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 ARID1B-206ENST00000452544 4443 ntTSL 26.77□□□□□ -1.335e-6■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 BCLAF1-210ENST00000529826 2423 ntTSL 56.76□□□□□ -1.332e-12■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 GFPT1-202ENST00000361060 8632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.345e-6■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 BCLAF1-216ENST00000532384 3237 ntTSL 56.46□□□□□ -1.384e-7■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 SERGEF-222ENST00000533241 539 ntTSL 46.34□□□□□ -1.395e-6■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 ADNP-202ENST00000371602 6115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.485e-6■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 SERGEF-204ENST00000525168 342 ntTSL 35.48□□□□□ -1.535e-6■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 PTPN12-209ENST00000460731 582 ntTSL 25.42□□□□□ -1.545e-6■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 BCLAF1-211ENST00000529917 1336 ntTSL 1 (best)5.42□□□□□ -1.544e-7■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.565e-6■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.594e-7■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 RAB3GAP1-204ENST00000487003 3506 ntTSL 55.01□□□□□ -1.615e-6■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 MTDH-202ENST00000519293 629 ntTSL 34.99□□□□□ -1.615e-6■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 ARID1B-231ENST00000637887 1468 ntTSL 54.99□□□□□ -1.615e-6■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 MTDH-204ENST00000521933 565 ntTSL 54.9□□□□□ -1.635e-6■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.714e-7■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.715e-6■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 BCLAF1-222ENST00000534792 552 ntTSL 24.25□□□□□ -1.732e-12■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 KMT2E-210ENST00000479838 883 ntTSL 24.25□□□□□ -1.734e-11■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 HNRNPC-229ENST00000557157 698 ntTSL 54.21□□□□□ -1.741e-7■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.764e-7■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 KMT2E-216ENST00000622386 1588 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.774e-8■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 BCLAF1-215ENST00000532076 560 ntTSL 43.97□□□□□ -1.772e-12■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 BAZ1A-209ENST00000555273 729 ntTSL 23.95□□□□□ -1.785e-6■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.784e-7■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 BCLAF1-219ENST00000534269 4239 ntTSL 1 (best)3.83□□□□□ -1.84e-7■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 BCLAF1-221ENST00000534762 744 ntTSL 33.76□□□□□ -1.814e-7■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 MTDH-205ENST00000522104 486 ntTSL 23.57□□□□□ -1.845e-6■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 BCLAF1-212ENST00000530429 3167 ntTSL 53.36□□□□□ -1.874e-7■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 BCLAF1-220ENST00000534321 519 ntTSL 23.21□□□□□ -1.92e-12■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.94e-7■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 BCLAF1-206ENST00000527613 5640 ntTSL 1 (best)2.81□□□□□ -1.964e-7■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.994e-7■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 BAZ1A-211ENST00000556314 673 ntTSL 21.25□□□□□ -2.215e-6■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 BCLAF1-224ENST00000640069 7719 ntTSL 51.22□□□□□ -2.214e-7■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 APOB-201ENST00000233242 14121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.263e-7■■■□□ 14.8
TRA2AQ13595 MACF1-227ENST00000524432 4338 ntTSL 515.29■□□□□ 0.042e-6■■■□□ 14.8
TRA2AQ13595 MORC3-201ENST00000400485 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.417e-12■■■□□ 14.8
TRA2AQ13595 MORC3-205ENST00000487909 4131 ntTSL 25.19□□□□□ -1.587e-12■■■□□ 14.8
TRA2AQ13595 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.517e-8■■■□□ 14.8
TRA2AQ13595 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.342e-44■■■□□ 14.8
TRA2AQ13595 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.052e-44■■■□□ 14.8
TRA2AQ13595 SEC63-204ENST00000459782 2025 ntTSL 1 (best)5.48□□□□□ -1.533e-11■■■□□ 14.8
TRA2AQ13595 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.246e-15■■■□□ 14.7
TRA2AQ13595 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.086e-15■■■□□ 14.7
TRA2AQ13595 SLC39A7-204ENST00000463972 1410 ntTSL 212.48□□□□□ -0.416e-15■■■□□ 14.7
TRA2AQ13595 SLC39A7-203ENST00000444757 1015 ntTSL 510.95□□□□□ -0.666e-15■■■□□ 14.7
TRA2AQ13595 AC079466.1-201ENST00000587961 4453 ntTSL 2 BASIC8.15□□□□□ -1.13e-6■■■□□ 14.7
TRA2AQ13595 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.293e-8■■■□□ 14.7
TRA2AQ13595 SSB-207ENST00000465871 421 ntTSL 34.16□□□□□ -1.743e-8■■■□□ 14.7
TRA2AQ13595 LUC7L3-210ENST00000507200 510 ntTSL 43.27□□□□□ -1.896e-9■■■□□ 14.7
TRA2AQ13595 SETD5-209ENST00000431285 1824 ntTSL 522.78■■□□□ 1.241e-6■■■□□ 14.7
TRA2AQ13595 SETD5-210ENST00000442373 900 ntTSL 58.36□□□□□ -1.071e-6■■■□□ 14.7
TRA2AQ13595 SMC4-203ENST00000462668 4235 ntTSL 23.08□□□□□ -1.927e-8■■■□□ 14.7
TRA2AQ13595 STRN3-207ENST00000555358 2208 ntTSL 1 (best)21.27■□□□□ 0.992e-6■■■□□ 14.7
TRA2AQ13595 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.072e-6■■■□□ 14.7
TRA2AQ13595 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.342e-6■■■□□ 14.7
TRA2AQ13595 STRN3-206ENST00000555152 567 ntTSL 43.72□□□□□ -1.812e-6■■■□□ 14.7
TRA2AQ13595 SETD5-211ENST00000443339 3478 ntTSL 29.76□□□□□ -0.859e-8■■■□□ 14.6
TRA2AQ13595 AFDN-221ENST00000511637 5999 ntTSL 1 (best)9.04□□□□□ -0.964e-8■■■□□ 14.6
TRA2AQ13595 RSRC2-203ENST00000392442 928 ntTSL 35.74□□□□□ -1.496e-7■■■□□ 14.6
TRA2AQ13595 RSRC2-206ENST00000525332 516 ntTSL 35.69□□□□□ -1.56e-7■■■□□ 14.6
TRA2AQ13595 BCLAF1-217ENST00000533422 692 ntTSL 34.71□□□□□ -1.666e-7■■■□□ 14.6
TRA2AQ13595 BCLAF1-209ENST00000529522 1093 ntTSL 24.55□□□□□ -1.686e-7■■■□□ 14.6
TRA2AQ13595 BCLAF1-204ENST00000526228 572 ntTSL 34.01□□□□□ -1.776e-7■■■□□ 14.6
TRA2AQ13595 EIF4E2-213ENST00000479834 681 ntTSL 320.59■□□□□ 0.894e-7■■■□□ 14.6
TRA2AQ13595 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.854e-7■■■□□ 14.6
TRA2AQ13595 YBX1-203ENST00000436427 1524 ntTSL 1 (best)20.31■□□□□ 0.844e-7■■■□□ 14.6
TRA2AQ13595 YBX1-202ENST00000332220 776 ntTSL 520.3■□□□□ 0.844e-7■■■□□ 14.6
TRA2AQ13595 EIF4E2-209ENST00000454501 1048 ntTSL 318.62■□□□□ 0.574e-7■■■□□ 14.6
TRA2AQ13595 YBX1-204ENST00000467957 770 ntTSL 218.3■□□□□ 0.524e-7■■■□□ 14.6
TRA2AQ13595 EIF4E2-211ENST00000463074 252 ntTSL 214.68□□□□□ -0.064e-7■■■□□ 14.6
TRA2AQ13595 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.114e-7■■■□□ 14.6
TRA2AQ13595 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.224e-7■■■□□ 14.6
Retrieved 100 of 7,337 protein–RNA pairs in 69.3 ms