Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2V1Q13404 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2V1Q13404 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2V1Q13404 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2V1Q13404 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
UBE2V1Q13404 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UBE2V1Q13404 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
UBE2V1Q13404 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UBE2V1Q13404 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UBE2V1Q13404 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UBE2V1Q13404 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UBE2V1Q13404 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
UBE2V1Q13404 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UBE2V1Q13404 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UBE2V1Q13404 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
UBE2V1Q13404 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
UBE2V1Q13404 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
UBE2V1Q13404 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
UBE2V1Q13404 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
UBE2V1Q13404 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
UBE2V1Q13404 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
UBE2V1Q13404 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
UBE2V1Q13404 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2V1Q13404 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2V1Q13404 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2V1Q13404 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2V1Q13404 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2V1Q13404 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2V1Q13404 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2V1Q13404 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2V1Q13404 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2V1Q13404 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2V1Q13404 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2V1Q13404 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2V1Q13404 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2V1Q13404 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2V1Q13404 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2V1Q13404 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2V1Q13404 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2V1Q13404 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2V1Q13404 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2V1Q13404 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2V1Q13404 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2V1Q13404 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2V1Q13404 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2V1Q13404 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2V1Q13404 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2V1Q13404 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2V1Q13404 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2V1Q13404 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2V1Q13404 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2V1Q13404 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2V1Q13404 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2V1Q13404 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2V1Q13404 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBE2V1Q13404 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBE2V1Q13404 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBE2V1Q13404 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBE2V1Q13404 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBE2V1Q13404 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBE2V1Q13404 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBE2V1Q13404 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBE2V1Q13404 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBE2V1Q13404 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBE2V1Q13404 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBE2V1Q13404 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBE2V1Q13404 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBE2V1Q13404 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBE2V1Q13404 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBE2V1Q13404 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBE2V1Q13404 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBE2V1Q13404 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBE2V1Q13404 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBE2V1Q13404 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBE2V1Q13404 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
UBE2V1Q13404 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBE2V1Q13404 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
UBE2V1Q13404 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBE2V1Q13404 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
UBE2V1Q13404 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBE2V1Q13404 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
UBE2V1Q13404 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBE2V1Q13404 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBE2V1Q13404 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBE2V1Q13404 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBE2V1Q13404 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBE2V1Q13404 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBE2V1Q13404 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBE2V1Q13404 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBE2V1Q13404 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBE2V1Q13404 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBE2V1Q13404 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBE2V1Q13404 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBE2V1Q13404 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBE2V1Q13404 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBE2V1Q13404 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBE2V1Q13404 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBE2V1Q13404 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBE2V1Q13404 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBE2V1Q13404 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms