Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHAF1BQ13112 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHAF1BQ13112 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHAF1BQ13112 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHAF1BQ13112 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHAF1BQ13112 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHAF1BQ13112 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CHAF1BQ13112 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHAF1BQ13112 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHAF1BQ13112 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHAF1BQ13112 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHAF1BQ13112 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHAF1BQ13112 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHAF1BQ13112 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHAF1BQ13112 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHAF1BQ13112 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHAF1BQ13112 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHAF1BQ13112 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHAF1BQ13112 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHAF1BQ13112 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHAF1BQ13112 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHAF1BQ13112 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHAF1BQ13112 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHAF1BQ13112 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHAF1BQ13112 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHAF1BQ13112 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHAF1BQ13112 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHAF1BQ13112 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHAF1BQ13112 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CHAF1BQ13112 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHAF1BQ13112 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHAF1BQ13112 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHAF1BQ13112 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHAF1BQ13112 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHAF1BQ13112 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHAF1BQ13112 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHAF1BQ13112 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHAF1BQ13112 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHAF1BQ13112 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHAF1BQ13112 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHAF1BQ13112 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHAF1BQ13112 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CHAF1BQ13112 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHAF1BQ13112 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHAF1BQ13112 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHAF1BQ13112 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHAF1BQ13112 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHAF1BQ13112 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHAF1BQ13112 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHAF1BQ13112 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHAF1BQ13112 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHAF1BQ13112 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHAF1BQ13112 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHAF1BQ13112 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CHAF1BQ13112 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHAF1BQ13112 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHAF1BQ13112 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHAF1BQ13112 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHAF1BQ13112 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHAF1BQ13112 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHAF1BQ13112 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHAF1BQ13112 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHAF1BQ13112 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CHAF1BQ13112 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHAF1BQ13112 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHAF1BQ13112 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CHAF1BQ13112 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHAF1BQ13112 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CHAF1BQ13112 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHAF1BQ13112 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHAF1BQ13112 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHAF1BQ13112 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHAF1BQ13112 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHAF1BQ13112 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHAF1BQ13112 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CHAF1BQ13112 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHAF1BQ13112 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHAF1BQ13112 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHAF1BQ13112 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHAF1BQ13112 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHAF1BQ13112 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHAF1BQ13112 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHAF1BQ13112 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHAF1BQ13112 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHAF1BQ13112 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHAF1BQ13112 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHAF1BQ13112 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHAF1BQ13112 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHAF1BQ13112 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHAF1BQ13112 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHAF1BQ13112 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHAF1BQ13112 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHAF1BQ13112 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CHAF1BQ13112 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHAF1BQ13112 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHAF1BQ13112 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHAF1BQ13112 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHAF1BQ13112 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHAF1BQ13112 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHAF1BQ13112 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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