Protein–RNA interactions for Protein: Q12872

SFSWAP, Splicing factor, suppressor of white-apricot homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 951 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFSWAPQ12872 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SFSWAPQ12872 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SFSWAPQ12872 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SFSWAPQ12872 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SFSWAPQ12872 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SFSWAPQ12872 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SFSWAPQ12872 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SFSWAPQ12872 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SFSWAPQ12872 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SFSWAPQ12872 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SFSWAPQ12872 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SFSWAPQ12872 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SFSWAPQ12872 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SFSWAPQ12872 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SFSWAPQ12872 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SFSWAPQ12872 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SFSWAPQ12872 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SFSWAPQ12872 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SFSWAPQ12872 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SFSWAPQ12872 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SFSWAPQ12872 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SFSWAPQ12872 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SFSWAPQ12872 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SFSWAPQ12872 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SFSWAPQ12872 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SFSWAPQ12872 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SFSWAPQ12872 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SFSWAPQ12872 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SFSWAPQ12872 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SFSWAPQ12872 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SFSWAPQ12872 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SFSWAPQ12872 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SFSWAPQ12872 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SFSWAPQ12872 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SFSWAPQ12872 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SFSWAPQ12872 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SFSWAPQ12872 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SFSWAPQ12872 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SFSWAPQ12872 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SFSWAPQ12872 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SFSWAPQ12872 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SFSWAPQ12872 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SFSWAPQ12872 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SFSWAPQ12872 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SFSWAPQ12872 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SFSWAPQ12872 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SFSWAPQ12872 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SFSWAPQ12872 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SFSWAPQ12872 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SFSWAPQ12872 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SFSWAPQ12872 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SFSWAPQ12872 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SFSWAPQ12872 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SFSWAPQ12872 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SFSWAPQ12872 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SFSWAPQ12872 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SFSWAPQ12872 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SFSWAPQ12872 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SFSWAPQ12872 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SFSWAPQ12872 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SFSWAPQ12872 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SFSWAPQ12872 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SFSWAPQ12872 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SFSWAPQ12872 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SFSWAPQ12872 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SFSWAPQ12872 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SFSWAPQ12872 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SFSWAPQ12872 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SFSWAPQ12872 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SFSWAPQ12872 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SFSWAPQ12872 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SFSWAPQ12872 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SFSWAPQ12872 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SFSWAPQ12872 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SFSWAPQ12872 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SFSWAPQ12872 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SFSWAPQ12872 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SFSWAPQ12872 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SFSWAPQ12872 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SFSWAPQ12872 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SFSWAPQ12872 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SFSWAPQ12872 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SFSWAPQ12872 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SFSWAPQ12872 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SFSWAPQ12872 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SFSWAPQ12872 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SFSWAPQ12872 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SFSWAPQ12872 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SFSWAPQ12872 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SFSWAPQ12872 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SFSWAPQ12872 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SFSWAPQ12872 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SFSWAPQ12872 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SFSWAPQ12872 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SFSWAPQ12872 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SFSWAPQ12872 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SFSWAPQ12872 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SFSWAPQ12872 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SFSWAPQ12872 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SFSWAPQ12872 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
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