Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NFIAQ12857 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NFIAQ12857 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NFIAQ12857 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NFIAQ12857 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NFIAQ12857 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NFIAQ12857 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NFIAQ12857 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NFIAQ12857 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NFIAQ12857 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NFIAQ12857 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NFIAQ12857 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NFIAQ12857 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NFIAQ12857 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NFIAQ12857 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NFIAQ12857 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NFIAQ12857 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NFIAQ12857 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NFIAQ12857 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NFIAQ12857 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NFIAQ12857 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NFIAQ12857 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NFIAQ12857 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NFIAQ12857 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NFIAQ12857 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NFIAQ12857 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NFIAQ12857 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NFIAQ12857 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NFIAQ12857 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NFIAQ12857 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NFIAQ12857 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NFIAQ12857 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NFIAQ12857 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NFIAQ12857 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NFIAQ12857 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NFIAQ12857 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NFIAQ12857 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NFIAQ12857 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NFIAQ12857 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NFIAQ12857 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NFIAQ12857 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NFIAQ12857 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NFIAQ12857 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NFIAQ12857 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NFIAQ12857 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NFIAQ12857 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NFIAQ12857 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NFIAQ12857 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NFIAQ12857 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NFIAQ12857 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NFIAQ12857 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NFIAQ12857 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NFIAQ12857 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NFIAQ12857 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NFIAQ12857 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NFIAQ12857 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NFIAQ12857 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NFIAQ12857 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NFIAQ12857 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NFIAQ12857 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NFIAQ12857 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NFIAQ12857 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NFIAQ12857 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NFIAQ12857 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NFIAQ12857 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NFIAQ12857 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NFIAQ12857 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NFIAQ12857 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NFIAQ12857 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NFIAQ12857 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NFIAQ12857 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NFIAQ12857 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NFIAQ12857 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NFIAQ12857 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NFIAQ12857 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NFIAQ12857 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NFIAQ12857 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NFIAQ12857 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NFIAQ12857 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NFIAQ12857 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NFIAQ12857 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NFIAQ12857 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NFIAQ12857 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NFIAQ12857 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NFIAQ12857 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NFIAQ12857 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NFIAQ12857 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NFIAQ12857 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NFIAQ12857 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NFIAQ12857 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NFIAQ12857 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NFIAQ12857 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NFIAQ12857 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NFIAQ12857 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NFIAQ12857 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NFIAQ12857 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NFIAQ12857 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NFIAQ12857 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NFIAQ12857 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NFIAQ12857 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
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