Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNMA1Q12791 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNMA1Q12791 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNMA1Q12791 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNMA1Q12791 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNMA1Q12791 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNMA1Q12791 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNMA1Q12791 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNMA1Q12791 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNMA1Q12791 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNMA1Q12791 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNMA1Q12791 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNMA1Q12791 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNMA1Q12791 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNMA1Q12791 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNMA1Q12791 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNMA1Q12791 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNMA1Q12791 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNMA1Q12791 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNMA1Q12791 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNMA1Q12791 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNMA1Q12791 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNMA1Q12791 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNMA1Q12791 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNMA1Q12791 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNMA1Q12791 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNMA1Q12791 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNMA1Q12791 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNMA1Q12791 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNMA1Q12791 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNMA1Q12791 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNMA1Q12791 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNMA1Q12791 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNMA1Q12791 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNMA1Q12791 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNMA1Q12791 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNMA1Q12791 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNMA1Q12791 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNMA1Q12791 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNMA1Q12791 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNMA1Q12791 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNMA1Q12791 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNMA1Q12791 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNMA1Q12791 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNMA1Q12791 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNMA1Q12791 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNMA1Q12791 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNMA1Q12791 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNMA1Q12791 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNMA1Q12791 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNMA1Q12791 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNMA1Q12791 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNMA1Q12791 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNMA1Q12791 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNMA1Q12791 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNMA1Q12791 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNMA1Q12791 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNMA1Q12791 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNMA1Q12791 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNMA1Q12791 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNMA1Q12791 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNMA1Q12791 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNMA1Q12791 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNMA1Q12791 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNMA1Q12791 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNMA1Q12791 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNMA1Q12791 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNMA1Q12791 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNMA1Q12791 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNMA1Q12791 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNMA1Q12791 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNMA1Q12791 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNMA1Q12791 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNMA1Q12791 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNMA1Q12791 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNMA1Q12791 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNMA1Q12791 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNMA1Q12791 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNMA1Q12791 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNMA1Q12791 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNMA1Q12791 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNMA1Q12791 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNMA1Q12791 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNMA1Q12791 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNMA1Q12791 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNMA1Q12791 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNMA1Q12791 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNMA1Q12791 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNMA1Q12791 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNMA1Q12791 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNMA1Q12791 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNMA1Q12791 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNMA1Q12791 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNMA1Q12791 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNMA1Q12791 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNMA1Q12791 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNMA1Q12791 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNMA1Q12791 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNMA1Q12791 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNMA1Q12791 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
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