Protein–RNA interactions for Protein: Q12316

TY1B-GR3, Transposon Ty1-GR3 Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-GR3Q12316 DUN1YDL101C 1542 nt3.59□□□□□ -1.83
TY1B-GR3Q12316 QCR10YHR001W-A 234 nt3.58□□□□□ -1.84
TY1B-GR3Q12316 LSM8YJR022W 330 nt3.58□□□□□ -1.84
TY1B-GR3Q12316 SPB1YCL054W 2526 nt3.58□□□□□ -1.84
TY1B-GR3Q12316 MAK11YKL021C 1407 nt3.58□□□□□ -1.84
TY1B-GR3Q12316 MEF1YLR069C 2286 nt3.58□□□□□ -1.84
TY1B-GR3Q12316 YFL065CYFL065C 309 nt3.58□□□□□ -1.84
TY1B-GR3Q12316 HSC82YMR186W 2118 nt3.58□□□□□ -1.84
TY1B-GR3Q12316 MGM1YOR211C 2646 nt3.58□□□□□ -1.84
TY1B-GR3Q12316 GCV2YMR189W 3105 nt3.58□□□□□ -1.84
TY1B-GR3Q12316 BRP1YGL007W 378 nt3.57□□□□□ -1.84
TY1B-GR3Q12316 IES3YLR052W 753 nt3.57□□□□□ -1.84
TY1B-GR3Q12316 ARG80YMR042W 534 nt3.57□□□□□ -1.84
TY1B-GR3Q12316 YNR062CYNR062C 984 nt3.57□□□□□ -1.84
TY1B-GR3Q12316 MCM16YPR046W 546 nt3.57□□□□□ -1.84
TY1B-GR3Q12316 CDC20YGL116W 1833 nt3.57□□□□□ -1.84
TY1B-GR3Q12316 ULS1YOR191W 4860 nt3.57□□□□□ -1.84
TY1B-GR3Q12316 HFA1YMR207C 6372 nt3.56□□□□□ -1.84
TY1B-GR3Q12316 NUP170YBL079W 4509 nt3.56□□□□□ -1.84
TY1B-GR3Q12316 SRO77YBL106C 3033 nt3.56□□□□□ -1.84
TY1B-GR3Q12316 CLN3YAL040C 1743 nt3.56□□□□□ -1.84
TY1B-GR3Q12316 EMP24YGL200C 612 nt3.56□□□□□ -1.84
TY1B-GR3Q12316 SBE2YDR351W 2595 nt3.55□□□□□ -1.84
TY1B-GR3Q12316 IKS1YJL057C 2004 nt3.55□□□□□ -1.84
TY1B-GR3Q12316 KSP1YHR082C 3090 nt3.55□□□□□ -1.84
TY1B-GR3Q12316 ROT1YMR200W 771 nt3.55□□□□□ -1.84
TY1B-GR3Q12316 MAL32YBR299W 1755 nt3.54□□□□□ -1.84
TY1B-GR3Q12316 RIM1YCR028C-A 408 nt3.54□□□□□ -1.84
TY1B-GR3Q12316 NUP100YKL068W 2880 nt3.54□□□□□ -1.84
TY1B-GR3Q12316 VIP1YLR410W 3441 nt3.53□□□□□ -1.84
TY1B-GR3Q12316 PEX4YGR133W 552 nt3.53□□□□□ -1.84
TY1B-GR3Q12316 SRL3YKR091W 741 nt3.53□□□□□ -1.84
TY1B-GR3Q12316 SEC66YBR171W 621 nt3.53□□□□□ -1.84
TY1B-GR3Q12316 GZF3YJL110C 1656 nt3.53□□□□□ -1.84
TY1B-GR3Q12316 YKR023WYKR023W 1593 nt3.52□□□□□ -1.85
TY1B-GR3Q12316 GLO1YML004C 981 nt3.52□□□□□ -1.85
TY1B-GR3Q12316 PNO1YOR145C 825 nt3.52□□□□□ -1.85
TY1B-GR3Q12316 PDR5YOR153W 4536 nt3.52□□□□□ -1.85
TY1B-GR3Q12316 SSE1YPL106C 2082 nt3.51□□□□□ -1.85
TY1B-GR3Q12316 YMR018WYMR018W 1545 nt3.51□□□□□ -1.85
TY1B-GR3Q12316 AIM32YML050W 936 nt3.51□□□□□ -1.85
TY1B-GR3Q12316 ERV41YML067C 1059 nt3.51□□□□□ -1.85
TY1B-GR3Q12316 ALK2YBL009W 2031 nt3.51□□□□□ -1.85
TY1B-GR3Q12316 MOB2YFL034C-B 864 nt3.51□□□□□ -1.85
TY1B-GR3Q12316 ACT1YFL039C 1128 nt3.51□□□□□ -1.85
TY1B-GR3Q12316 SRB5YGR104C 924 nt3.51□□□□□ -1.85
TY1B-GR3Q12316 SRT1YMR101C 1032 nt3.51□□□□□ -1.85
TY1B-GR3Q12316 GYP5YPL249C 2685 nt3.5□□□□□ -1.85
TY1B-GR3Q12316 SIN4YNL236W 2925 nt3.5□□□□□ -1.85
TY1B-GR3Q12316 ATG23YLR431C 1362 nt3.5□□□□□ -1.85
TY1B-GR3Q12316 SSD1YDR293C 3753 nt3.49□□□□□ -1.85
TY1B-GR3Q12316 RFT1YBL020W 1725 nt3.49□□□□□ -1.85
TY1B-GR3Q12316 SPT16YGL207W 3108 nt3.49□□□□□ -1.85
TY1B-GR3Q12316 CDC9YDL164C 2268 nt3.49□□□□□ -1.85
TY1B-GR3Q12316 DLS1YJL065C 504 nt3.48□□□□□ -1.85
TY1B-GR3Q12316 TAO3YIL129C 7131 nt3.48□□□□□ -1.85
TY1B-GR3Q12316 SMC2YFR031C 3513 nt3.48□□□□□ -1.85
TY1B-GR3Q12316 PRM7YDL039C 2097 nt3.48□□□□□ -1.85
TY1B-GR3Q12316 YGL024WYGL024W 336 nt3.48□□□□□ -1.85
TY1B-GR3Q12316 EMG1YLR186W 759 nt3.48□□□□□ -1.85
TY1B-GR3Q12316 SLM5YCR024C 1479 nt3.47□□□□□ -1.85
TY1B-GR3Q12316 RPN1YHR027C 2982 nt3.47□□□□□ -1.85
TY1B-GR3Q12316 BYE1YKL005C 1785 nt3.47□□□□□ -1.85
TY1B-GR3Q12316 STB2YMR053C 2553 nt3.46□□□□□ -1.85
TY1B-GR3Q12316 RPS16BYDL083C 432 nt3.46□□□□□ -1.86
TY1B-GR3Q12316 QRI7YDL104C 1224 nt3.46□□□□□ -1.86
TY1B-GR3Q12316 SPT2YER161C 1002 nt3.46□□□□□ -1.86
TY1B-GR3Q12316 YIR020W-AYIR020W-A 243 nt3.46□□□□□ -1.86
TY1B-GR3Q12316 YJR098CYJR098C 1971 nt3.46□□□□□ -1.86
TY1B-GR3Q12316 GIS4YML006C 2325 nt3.46□□□□□ -1.86
TY1B-GR3Q12316 GAL80YML051W 1308 nt3.46□□□□□ -1.86
TY1B-GR3Q12316 GCN4YEL009C 846 nt3.46□□□□□ -1.86
TY1B-GR3Q12316 RPL27AYHR010W 411 nt3.46□□□□□ -1.86
TY1B-GR3Q12316 YLR125WYLR125W 411 nt3.46□□□□□ -1.86
TY1B-GR3Q12316 BCK2YER167W 2556 nt3.45□□□□□ -1.86
TY1B-GR3Q12316 REV3YPL167C 4515 nt3.45□□□□□ -1.86
TY1B-GR3Q12316 MSA1YOR066W 1890 nt3.45□□□□□ -1.86
TY1B-GR3Q12316 DIS3YOL021C 3006 nt3.45□□□□□ -1.86
TY1B-GR3Q12316 INO4YOL108C 456 nt3.45□□□□□ -1.86
TY1B-GR3Q12316 GCN1YGL195W 8019 nt3.44□□□□□ -1.86
TY1B-GR3Q12316 YKR073CYKR073C 321 nt3.44□□□□□ -1.86
TY1B-GR3Q12316 SIP18YMR175W 240 nt3.44□□□□□ -1.86
TY1B-GR3Q12316 RPC34YNR003C 954 nt3.44□□□□□ -1.86
TY1B-GR3Q12316 RTS1YOR014W 2274 nt3.44□□□□□ -1.86
TY1B-GR3Q12316 NSP1YJL041W 2472 nt3.43□□□□□ -1.86
TY1B-GR3Q12316 IRC8YJL051W 2469 nt3.43□□□□□ -1.86
TY1B-GR3Q12316 NOP13YNL175C 1212 nt3.43□□□□□ -1.86
TY1B-GR3Q12316 CST9YLR394W 1449 nt3.43□□□□□ -1.86
TY1B-GR3Q12316 GEP4YHR100C 558 nt3.43□□□□□ -1.86
TY1B-GR3Q12316 ATG17YLR423C 1254 nt3.42□□□□□ -1.86
TY1B-GR3Q12316 MRPS9YBR146W 837 nt3.42□□□□□ -1.86
TY1B-GR3Q12316 ATG1YGL180W 2694 nt3.41□□□□□ -1.86
TY1B-GR3Q12316 TEL1YBL088C 8364 nt3.41□□□□□ -1.86
TY1B-GR3Q12316 YBR209WYBR209W 318 nt3.4□□□□□ -1.86
TY1B-GR3Q12316 GIP4YAL031C 2283 nt3.4□□□□□ -1.86
TY1B-GR3Q12316 PEX8YGR077C 1770 nt3.4□□□□□ -1.87
TY1B-GR3Q12316 YNL013CYNL013C 378 nt3.4□□□□□ -1.87
TY1B-GR3Q12316 HSH155YMR288W 2916 nt3.4□□□□□ -1.87
TY1B-GR3Q12316 PDC2YDR081C 2778 nt3.4□□□□□ -1.87
TY1B-GR3Q12316 ATG7YHR171W 1893 nt3.39□□□□□ -1.87
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