Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDE4DQ08499 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDE4DQ08499 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDE4DQ08499 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDE4DQ08499 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDE4DQ08499 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDE4DQ08499 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDE4DQ08499 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDE4DQ08499 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDE4DQ08499 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PDE4DQ08499 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDE4DQ08499 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDE4DQ08499 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDE4DQ08499 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDE4DQ08499 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDE4DQ08499 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDE4DQ08499 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDE4DQ08499 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDE4DQ08499 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDE4DQ08499 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDE4DQ08499 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDE4DQ08499 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDE4DQ08499 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDE4DQ08499 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDE4DQ08499 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDE4DQ08499 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDE4DQ08499 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDE4DQ08499 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDE4DQ08499 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PDE4DQ08499 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PDE4DQ08499 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PDE4DQ08499 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PDE4DQ08499 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PDE4DQ08499 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PDE4DQ08499 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PDE4DQ08499 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PDE4DQ08499 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PDE4DQ08499 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDE4DQ08499 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDE4DQ08499 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDE4DQ08499 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDE4DQ08499 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDE4DQ08499 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDE4DQ08499 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDE4DQ08499 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDE4DQ08499 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDE4DQ08499 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PDE4DQ08499 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDE4DQ08499 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDE4DQ08499 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDE4DQ08499 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDE4DQ08499 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDE4DQ08499 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDE4DQ08499 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDE4DQ08499 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PDE4DQ08499 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDE4DQ08499 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDE4DQ08499 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDE4DQ08499 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDE4DQ08499 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDE4DQ08499 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDE4DQ08499 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PDE4DQ08499 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDE4DQ08499 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDE4DQ08499 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDE4DQ08499 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDE4DQ08499 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDE4DQ08499 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDE4DQ08499 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PDE4DQ08499 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PDE4DQ08499 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDE4DQ08499 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE4DQ08499 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE4DQ08499 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE4DQ08499 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE4DQ08499 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE4DQ08499 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE4DQ08499 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE4DQ08499 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE4DQ08499 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE4DQ08499 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE4DQ08499 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE4DQ08499 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE4DQ08499 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE4DQ08499 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE4DQ08499 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE4DQ08499 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE4DQ08499 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE4DQ08499 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE4DQ08499 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE4DQ08499 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE4DQ08499 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE4DQ08499 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE4DQ08499 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE4DQ08499 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE4DQ08499 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE4DQ08499 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE4DQ08499 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE4DQ08499 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE4DQ08499 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms