Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LTBQ06643 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LTBQ06643 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LTBQ06643 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LTBQ06643 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LTBQ06643 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LTBQ06643 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LTBQ06643 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LTBQ06643 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
LTBQ06643 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LTBQ06643 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LTBQ06643 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LTBQ06643 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LTBQ06643 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LTBQ06643 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LTBQ06643 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LTBQ06643 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LTBQ06643 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LTBQ06643 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LTBQ06643 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LTBQ06643 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LTBQ06643 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LTBQ06643 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LTBQ06643 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
LTBQ06643 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LTBQ06643 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LTBQ06643 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LTBQ06643 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LTBQ06643 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LTBQ06643 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LTBQ06643 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LTBQ06643 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LTBQ06643 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LTBQ06643 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LTBQ06643 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
LTBQ06643 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LTBQ06643 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LTBQ06643 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LTBQ06643 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
LTBQ06643 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
LTBQ06643 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LTBQ06643 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LTBQ06643 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LTBQ06643 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LTBQ06643 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LTBQ06643 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LTBQ06643 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LTBQ06643 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LTBQ06643 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LTBQ06643 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LTBQ06643 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LTBQ06643 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LTBQ06643 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
LTBQ06643 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LTBQ06643 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LTBQ06643 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LTBQ06643 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LTBQ06643 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LTBQ06643 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LTBQ06643 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LTBQ06643 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LTBQ06643 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LTBQ06643 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LTBQ06643 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
LTBQ06643 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LTBQ06643 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LTBQ06643 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LTBQ06643 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LTBQ06643 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
LTBQ06643 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LTBQ06643 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LTBQ06643 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LTBQ06643 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LTBQ06643 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LTBQ06643 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LTBQ06643 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
LTBQ06643 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LTBQ06643 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LTBQ06643 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LTBQ06643 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LTBQ06643 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LTBQ06643 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LTBQ06643 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LTBQ06643 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LTBQ06643 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LTBQ06643 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LTBQ06643 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LTBQ06643 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
LTBQ06643 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LTBQ06643 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LTBQ06643 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LTBQ06643 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LTBQ06643 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
LTBQ06643 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LTBQ06643 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LTBQ06643 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LTBQ06643 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LTBQ06643 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
LTBQ06643 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LTBQ06643 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms