Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABPB1Q06547 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GABPB1Q06547 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABPB1Q06547 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABPB1Q06547 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABPB1Q06547 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABPB1Q06547 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABPB1Q06547 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABPB1Q06547 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABPB1Q06547 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABPB1Q06547 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABPB1Q06547 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GABPB1Q06547 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABPB1Q06547 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABPB1Q06547 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABPB1Q06547 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABPB1Q06547 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABPB1Q06547 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABPB1Q06547 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABPB1Q06547 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABPB1Q06547 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABPB1Q06547 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABPB1Q06547 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABPB1Q06547 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABPB1Q06547 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABPB1Q06547 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABPB1Q06547 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABPB1Q06547 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABPB1Q06547 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABPB1Q06547 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABPB1Q06547 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABPB1Q06547 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABPB1Q06547 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABPB1Q06547 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABPB1Q06547 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GABPB1Q06547 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABPB1Q06547 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABPB1Q06547 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABPB1Q06547 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABPB1Q06547 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABPB1Q06547 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABPB1Q06547 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABPB1Q06547 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABPB1Q06547 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABPB1Q06547 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABPB1Q06547 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABPB1Q06547 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABPB1Q06547 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABPB1Q06547 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABPB1Q06547 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABPB1Q06547 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABPB1Q06547 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GABPB1Q06547 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GABPB1Q06547 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABPB1Q06547 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABPB1Q06547 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABPB1Q06547 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABPB1Q06547 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABPB1Q06547 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABPB1Q06547 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABPB1Q06547 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABPB1Q06547 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABPB1Q06547 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABPB1Q06547 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABPB1Q06547 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABPB1Q06547 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABPB1Q06547 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABPB1Q06547 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABPB1Q06547 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABPB1Q06547 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GABPB1Q06547 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GABPB1Q06547 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GABPB1Q06547 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GABPB1Q06547 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GABPB1Q06547 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GABPB1Q06547 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GABPB1Q06547 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GABPB1Q06547 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GABPB1Q06547 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GABPB1Q06547 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GABPB1Q06547 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GABPB1Q06547 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GABPB1Q06547 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GABPB1Q06547 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABPB1Q06547 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABPB1Q06547 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABPB1Q06547 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABPB1Q06547 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABPB1Q06547 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABPB1Q06547 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABPB1Q06547 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GABPB1Q06547 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABPB1Q06547 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABPB1Q06547 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABPB1Q06547 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABPB1Q06547 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABPB1Q06547 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABPB1Q06547 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABPB1Q06547 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABPB1Q06547 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms