Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPN12Q05209 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPN12Q05209 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPN12Q05209 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPN12Q05209 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPN12Q05209 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPN12Q05209 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPN12Q05209 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPN12Q05209 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPN12Q05209 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPN12Q05209 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPN12Q05209 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPN12Q05209 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPN12Q05209 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPN12Q05209 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPN12Q05209 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPN12Q05209 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPN12Q05209 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPN12Q05209 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPN12Q05209 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPN12Q05209 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPN12Q05209 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPN12Q05209 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPN12Q05209 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPN12Q05209 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPN12Q05209 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPN12Q05209 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPN12Q05209 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPN12Q05209 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPN12Q05209 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPN12Q05209 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPN12Q05209 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPN12Q05209 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPN12Q05209 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPN12Q05209 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPN12Q05209 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPN12Q05209 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPN12Q05209 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPN12Q05209 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPN12Q05209 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPN12Q05209 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPN12Q05209 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPN12Q05209 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPN12Q05209 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPN12Q05209 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
PTPN12Q05209 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
PTPN12Q05209 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
PTPN12Q05209 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPN12Q05209 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPN12Q05209 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPN12Q05209 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPN12Q05209 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPN12Q05209 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPN12Q05209 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPN12Q05209 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPN12Q05209 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPN12Q05209 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPN12Q05209 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPN12Q05209 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPN12Q05209 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPN12Q05209 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPN12Q05209 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPN12Q05209 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPN12Q05209 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPN12Q05209 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPN12Q05209 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPN12Q05209 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPN12Q05209 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPN12Q05209 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPN12Q05209 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPN12Q05209 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPN12Q05209 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPN12Q05209 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPN12Q05209 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPN12Q05209 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPN12Q05209 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPN12Q05209 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPN12Q05209 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPN12Q05209 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPN12Q05209 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPN12Q05209 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPN12Q05209 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPN12Q05209 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPN12Q05209 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPN12Q05209 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPN12Q05209 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPN12Q05209 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPN12Q05209 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPN12Q05209 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPN12Q05209 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPN12Q05209 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPN12Q05209 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPN12Q05209 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPN12Q05209 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPN12Q05209 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPN12Q05209 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPN12Q05209 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPN12Q05209 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPN12Q05209 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPN12Q05209 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms