Protein–RNA interactions for Protein: Q02446

SP4, Transcription factor Sp4, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP4Q02446 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SP4Q02446 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SP4Q02446 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SP4Q02446 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SP4Q02446 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SP4Q02446 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SP4Q02446 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SP4Q02446 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SP4Q02446 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SP4Q02446 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SP4Q02446 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SP4Q02446 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SP4Q02446 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SP4Q02446 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SP4Q02446 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SP4Q02446 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SP4Q02446 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SP4Q02446 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SP4Q02446 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SP4Q02446 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SP4Q02446 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SP4Q02446 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SP4Q02446 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SP4Q02446 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SP4Q02446 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SP4Q02446 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SP4Q02446 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SP4Q02446 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SP4Q02446 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SP4Q02446 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SP4Q02446 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SP4Q02446 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SP4Q02446 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SP4Q02446 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SP4Q02446 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SP4Q02446 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SP4Q02446 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SP4Q02446 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SP4Q02446 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SP4Q02446 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SP4Q02446 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SP4Q02446 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SP4Q02446 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SP4Q02446 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SP4Q02446 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SP4Q02446 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SP4Q02446 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SP4Q02446 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SP4Q02446 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SP4Q02446 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SP4Q02446 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SP4Q02446 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SP4Q02446 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SP4Q02446 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SP4Q02446 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SP4Q02446 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SP4Q02446 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SP4Q02446 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SP4Q02446 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SP4Q02446 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SP4Q02446 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SP4Q02446 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SP4Q02446 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SP4Q02446 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SP4Q02446 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SP4Q02446 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SP4Q02446 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SP4Q02446 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SP4Q02446 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SP4Q02446 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SP4Q02446 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SP4Q02446 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SP4Q02446 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SP4Q02446 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SP4Q02446 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SP4Q02446 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SP4Q02446 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SP4Q02446 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SP4Q02446 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SP4Q02446 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SP4Q02446 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SP4Q02446 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SP4Q02446 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SP4Q02446 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SP4Q02446 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SP4Q02446 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SP4Q02446 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SP4Q02446 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SP4Q02446 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SP4Q02446 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SP4Q02446 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SP4Q02446 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SP4Q02446 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SP4Q02446 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SP4Q02446 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SP4Q02446 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SP4Q02446 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SP4Q02446 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SP4Q02446 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SP4Q02446 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms