Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYP27A1Q02318 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYP27A1Q02318 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYP27A1Q02318 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYP27A1Q02318 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYP27A1Q02318 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYP27A1Q02318 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYP27A1Q02318 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYP27A1Q02318 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYP27A1Q02318 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CYP27A1Q02318 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP27A1Q02318 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP27A1Q02318 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP27A1Q02318 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP27A1Q02318 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP27A1Q02318 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP27A1Q02318 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP27A1Q02318 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP27A1Q02318 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP27A1Q02318 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP27A1Q02318 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP27A1Q02318 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP27A1Q02318 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP27A1Q02318 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP27A1Q02318 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP27A1Q02318 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP27A1Q02318 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP27A1Q02318 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP27A1Q02318 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP27A1Q02318 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP27A1Q02318 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP27A1Q02318 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP27A1Q02318 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP27A1Q02318 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP27A1Q02318 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP27A1Q02318 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP27A1Q02318 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP27A1Q02318 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP27A1Q02318 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP27A1Q02318 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP27A1Q02318 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP27A1Q02318 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP27A1Q02318 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP27A1Q02318 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP27A1Q02318 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP27A1Q02318 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP27A1Q02318 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP27A1Q02318 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP27A1Q02318 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP27A1Q02318 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP27A1Q02318 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP27A1Q02318 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP27A1Q02318 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP27A1Q02318 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP27A1Q02318 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP27A1Q02318 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP27A1Q02318 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP27A1Q02318 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP27A1Q02318 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP27A1Q02318 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP27A1Q02318 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP27A1Q02318 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP27A1Q02318 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP27A1Q02318 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP27A1Q02318 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP27A1Q02318 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP27A1Q02318 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP27A1Q02318 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP27A1Q02318 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP27A1Q02318 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP27A1Q02318 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP27A1Q02318 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP27A1Q02318 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP27A1Q02318 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP27A1Q02318 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP27A1Q02318 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP27A1Q02318 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP27A1Q02318 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP27A1Q02318 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP27A1Q02318 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP27A1Q02318 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP27A1Q02318 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP27A1Q02318 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP27A1Q02318 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP27A1Q02318 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP27A1Q02318 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP27A1Q02318 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CYP27A1Q02318 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CYP27A1Q02318 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CYP27A1Q02318 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CYP27A1Q02318 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CYP27A1Q02318 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CYP27A1Q02318 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CYP27A1Q02318 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CYP27A1Q02318 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CYP27A1Q02318 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CYP27A1Q02318 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYP27A1Q02318 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYP27A1Q02318 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYP27A1Q02318 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms