Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RPS29P62273 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RPS29P62273 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RPS29P62273 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RPS29P62273 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RPS29P62273 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RPS29P62273 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RPS29P62273 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RPS29P62273 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RPS29P62273 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RPS29P62273 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RPS29P62273 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RPS29P62273 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RPS29P62273 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RPS29P62273 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RPS29P62273 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RPS29P62273 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RPS29P62273 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RPS29P62273 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RPS29P62273 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RPS29P62273 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RPS29P62273 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RPS29P62273 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RPS29P62273 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RPS29P62273 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RPS29P62273 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RPS29P62273 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RPS29P62273 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RPS29P62273 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RPS29P62273 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RPS29P62273 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RPS29P62273 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RPS29P62273 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RPS29P62273 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RPS29P62273 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RPS29P62273 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RPS29P62273 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RPS29P62273 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RPS29P62273 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RPS29P62273 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RPS29P62273 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RPS29P62273 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RPS29P62273 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RPS29P62273 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RPS29P62273 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RPS29P62273 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RPS29P62273 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RPS29P62273 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RPS29P62273 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RPS29P62273 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RPS29P62273 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RPS29P62273 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RPS29P62273 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RPS29P62273 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RPS29P62273 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RPS29P62273 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RPS29P62273 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RPS29P62273 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RPS29P62273 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RPS29P62273 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RPS29P62273 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RPS29P62273 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RPS29P62273 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RPS29P62273 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RPS29P62273 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RPS29P62273 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RPS29P62273 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RPS29P62273 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RPS29P62273 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RPS29P62273 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
RPS29P62273 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RPS29P62273 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RPS29P62273 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RPS29P62273 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RPS29P62273 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
RPS29P62273 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
RPS29P62273 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RPS29P62273 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RPS29P62273 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RPS29P62273 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RPS29P62273 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
RPS29P62273 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
RPS29P62273 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
RPS29P62273 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RPS29P62273 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RPS29P62273 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
RPS29P62273 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RPS29P62273 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC12.21□□□□□ -0.45
RPS29P62273 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RPS29P62273 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
RPS29P62273 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
RPS29P62273 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
RPS29P62273 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
RPS29P62273 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RPS29P62273 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
RPS29P62273 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
RPS29P62273 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
RPS29P62273 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
RPS29P62273 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
RPS29P62273 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
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