Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTBP60709 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTBP60709 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTBP60709 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTBP60709 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTBP60709 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTBP60709 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTBP60709 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTBP60709 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTBP60709 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTBP60709 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTBP60709 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTBP60709 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTBP60709 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTBP60709 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTBP60709 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTBP60709 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTBP60709 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTBP60709 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTBP60709 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTBP60709 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTBP60709 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTBP60709 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTBP60709 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTBP60709 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTBP60709 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTBP60709 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTBP60709 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTBP60709 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTBP60709 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTBP60709 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTBP60709 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTBP60709 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTBP60709 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTBP60709 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTBP60709 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTBP60709 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTBP60709 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTBP60709 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTBP60709 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTBP60709 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTBP60709 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTBP60709 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTBP60709 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTBP60709 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTBP60709 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTBP60709 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTBP60709 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTBP60709 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTBP60709 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTBP60709 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTBP60709 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTBP60709 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTBP60709 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTBP60709 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTBP60709 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTBP60709 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTBP60709 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTBP60709 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTBP60709 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTBP60709 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTBP60709 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTBP60709 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTBP60709 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTBP60709 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTBP60709 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTBP60709 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTBP60709 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTBP60709 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTBP60709 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTBP60709 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTBP60709 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTBP60709 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTBP60709 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTBP60709 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTBP60709 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTBP60709 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTBP60709 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTBP60709 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTBP60709 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTBP60709 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTBP60709 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTBP60709 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTBP60709 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTBP60709 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTBP60709 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTBP60709 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTBP60709 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTBP60709 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTBP60709 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTBP60709 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTBP60709 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ACTBP60709 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ACTBP60709 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ACTBP60709 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ACTBP60709 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACTBP60709 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACTBP60709 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACTBP60709 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACTBP60709 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms