Protein–RNA interactions for Protein: P60602

ROMO1, Reactive oxygen species modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROMO1P60602 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
ROMO1P60602 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
ROMO1P60602 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ROMO1P60602 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
ROMO1P60602 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ROMO1P60602 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
ROMO1P60602 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
ROMO1P60602 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
ROMO1P60602 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
ROMO1P60602 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
ROMO1P60602 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
ROMO1P60602 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC10□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms