Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms