Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUP107P57740 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUP107P57740 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUP107P57740 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUP107P57740 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUP107P57740 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUP107P57740 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUP107P57740 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUP107P57740 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUP107P57740 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUP107P57740 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUP107P57740 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUP107P57740 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUP107P57740 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUP107P57740 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUP107P57740 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUP107P57740 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUP107P57740 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUP107P57740 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUP107P57740 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUP107P57740 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUP107P57740 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUP107P57740 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUP107P57740 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUP107P57740 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUP107P57740 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUP107P57740 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUP107P57740 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUP107P57740 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUP107P57740 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NUP107P57740 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUP107P57740 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUP107P57740 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUP107P57740 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUP107P57740 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUP107P57740 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUP107P57740 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUP107P57740 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUP107P57740 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUP107P57740 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUP107P57740 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUP107P57740 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUP107P57740 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUP107P57740 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUP107P57740 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUP107P57740 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUP107P57740 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUP107P57740 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUP107P57740 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUP107P57740 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUP107P57740 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUP107P57740 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUP107P57740 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
NUP107P57740 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUP107P57740 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUP107P57740 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NUP107P57740 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NUP107P57740 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NUP107P57740 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NUP107P57740 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NUP107P57740 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NUP107P57740 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NUP107P57740 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NUP107P57740 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NUP107P57740 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NUP107P57740 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NUP107P57740 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NUP107P57740 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NUP107P57740 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NUP107P57740 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NUP107P57740 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NUP107P57740 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUP107P57740 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUP107P57740 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUP107P57740 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUP107P57740 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUP107P57740 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUP107P57740 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUP107P57740 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUP107P57740 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUP107P57740 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUP107P57740 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUP107P57740 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUP107P57740 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUP107P57740 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUP107P57740 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUP107P57740 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUP107P57740 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NUP107P57740 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUP107P57740 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUP107P57740 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUP107P57740 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUP107P57740 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUP107P57740 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUP107P57740 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUP107P57740 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUP107P57740 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NUP107P57740 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NUP107P57740 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUP107P57740 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms