Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NME5P56597 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NME5P56597 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NME5P56597 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NME5P56597 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NME5P56597 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NME5P56597 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NME5P56597 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NME5P56597 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NME5P56597 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NME5P56597 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
NME5P56597 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NME5P56597 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NME5P56597 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NME5P56597 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
NME5P56597 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NME5P56597 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NME5P56597 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NME5P56597 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NME5P56597 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NME5P56597 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NME5P56597 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NME5P56597 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NME5P56597 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NME5P56597 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NME5P56597 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
NME5P56597 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NME5P56597 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NME5P56597 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NME5P56597 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
NME5P56597 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NME5P56597 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
NME5P56597 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
NME5P56597 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NME5P56597 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NME5P56597 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NME5P56597 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NME5P56597 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NME5P56597 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NME5P56597 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NME5P56597 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NME5P56597 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NME5P56597 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NME5P56597 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NME5P56597 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NME5P56597 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NME5P56597 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NME5P56597 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NME5P56597 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NME5P56597 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NME5P56597 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NME5P56597 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NME5P56597 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NME5P56597 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NME5P56597 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NME5P56597 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NME5P56597 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NME5P56597 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
NME5P56597 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NME5P56597 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NME5P56597 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NME5P56597 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
NME5P56597 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
NME5P56597 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NME5P56597 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NME5P56597 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NME5P56597 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NME5P56597 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NME5P56597 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NME5P56597 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NME5P56597 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NME5P56597 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NME5P56597 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NME5P56597 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NME5P56597 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
NME5P56597 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NME5P56597 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NME5P56597 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NME5P56597 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NME5P56597 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NME5P56597 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
NME5P56597 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NME5P56597 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NME5P56597 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NME5P56597 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NME5P56597 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NME5P56597 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NME5P56597 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NME5P56597 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NME5P56597 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NME5P56597 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NME5P56597 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NME5P56597 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NME5P56597 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NME5P56597 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
NME5P56597 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
NME5P56597 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
NME5P56597 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
NME5P56597 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NME5P56597 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms