Protein–RNA interactions for Protein: P56278

MTCP1, Protein p13 MTCP-1, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTCP1P56278 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
MTCP1P56278 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTCP1P56278 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTCP1P56278 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTCP1P56278 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTCP1P56278 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTCP1P56278 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTCP1P56278 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTCP1P56278 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTCP1P56278 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTCP1P56278 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTCP1P56278 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTCP1P56278 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTCP1P56278 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MTCP1P56278 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTCP1P56278 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTCP1P56278 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTCP1P56278 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTCP1P56278 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTCP1P56278 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTCP1P56278 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTCP1P56278 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTCP1P56278 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTCP1P56278 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTCP1P56278 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTCP1P56278 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTCP1P56278 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTCP1P56278 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTCP1P56278 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MTCP1P56278 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTCP1P56278 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTCP1P56278 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTCP1P56278 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MTCP1P56278 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTCP1P56278 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTCP1P56278 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTCP1P56278 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTCP1P56278 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTCP1P56278 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTCP1P56278 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTCP1P56278 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTCP1P56278 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTCP1P56278 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTCP1P56278 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTCP1P56278 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTCP1P56278 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTCP1P56278 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTCP1P56278 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTCP1P56278 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTCP1P56278 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTCP1P56278 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTCP1P56278 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTCP1P56278 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTCP1P56278 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTCP1P56278 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MTCP1P56278 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTCP1P56278 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTCP1P56278 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTCP1P56278 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTCP1P56278 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTCP1P56278 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTCP1P56278 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTCP1P56278 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTCP1P56278 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTCP1P56278 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MTCP1P56278 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTCP1P56278 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTCP1P56278 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTCP1P56278 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTCP1P56278 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTCP1P56278 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTCP1P56278 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTCP1P56278 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTCP1P56278 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTCP1P56278 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTCP1P56278 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTCP1P56278 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTCP1P56278 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTCP1P56278 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTCP1P56278 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTCP1P56278 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTCP1P56278 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTCP1P56278 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MTCP1P56278 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms