Protein–RNA interactions for Protein: P54849

EMP1, Epithelial membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP1P54849 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EMP1P54849 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EMP1P54849 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
EMP1P54849 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
EMP1P54849 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EMP1P54849 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EMP1P54849 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EMP1P54849 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EMP1P54849 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EMP1P54849 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EMP1P54849 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EMP1P54849 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EMP1P54849 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EMP1P54849 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EMP1P54849 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EMP1P54849 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EMP1P54849 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EMP1P54849 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EMP1P54849 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EMP1P54849 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EMP1P54849 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EMP1P54849 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EMP1P54849 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EMP1P54849 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EMP1P54849 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EMP1P54849 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EMP1P54849 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EMP1P54849 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EMP1P54849 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EMP1P54849 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EMP1P54849 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EMP1P54849 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EMP1P54849 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EMP1P54849 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EMP1P54849 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EMP1P54849 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
EMP1P54849 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EMP1P54849 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EMP1P54849 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EMP1P54849 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EMP1P54849 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EMP1P54849 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EMP1P54849 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EMP1P54849 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EMP1P54849 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EMP1P54849 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EMP1P54849 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EMP1P54849 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EMP1P54849 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
EMP1P54849 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EMP1P54849 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EMP1P54849 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EMP1P54849 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
EMP1P54849 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EMP1P54849 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EMP1P54849 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EMP1P54849 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EMP1P54849 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EMP1P54849 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EMP1P54849 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EMP1P54849 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EMP1P54849 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EMP1P54849 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EMP1P54849 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EMP1P54849 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EMP1P54849 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EMP1P54849 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EMP1P54849 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EMP1P54849 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EMP1P54849 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EMP1P54849 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EMP1P54849 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EMP1P54849 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EMP1P54849 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
EMP1P54849 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EMP1P54849 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EMP1P54849 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EMP1P54849 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EMP1P54849 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EMP1P54849 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EMP1P54849 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EMP1P54849 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
EMP1P54849 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EMP1P54849 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EMP1P54849 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EMP1P54849 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EMP1P54849 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EMP1P54849 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EMP1P54849 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EMP1P54849 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EMP1P54849 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EMP1P54849 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EMP1P54849 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EMP1P54849 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EMP1P54849 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EMP1P54849 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EMP1P54849 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EMP1P54849 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EMP1P54849 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EMP1P54849 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms