Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ITGA8P53708 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGA8P53708 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGA8P53708 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGA8P53708 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGA8P53708 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGA8P53708 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGA8P53708 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGA8P53708 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGA8P53708 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGA8P53708 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGA8P53708 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGA8P53708 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGA8P53708 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITGA8P53708 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITGA8P53708 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITGA8P53708 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITGA8P53708 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ITGA8P53708 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITGA8P53708 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITGA8P53708 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ITGA8P53708 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ITGA8P53708 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ITGA8P53708 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ITGA8P53708 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITGA8P53708 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITGA8P53708 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITGA8P53708 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA8P53708 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA8P53708 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA8P53708 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA8P53708 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA8P53708 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA8P53708 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA8P53708 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA8P53708 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA8P53708 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA8P53708 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA8P53708 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA8P53708 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA8P53708 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA8P53708 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA8P53708 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA8P53708 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA8P53708 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA8P53708 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA8P53708 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA8P53708 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA8P53708 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA8P53708 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA8P53708 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA8P53708 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA8P53708 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA8P53708 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA8P53708 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA8P53708 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA8P53708 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA8P53708 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA8P53708 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA8P53708 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA8P53708 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA8P53708 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA8P53708 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA8P53708 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA8P53708 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA8P53708 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA8P53708 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA8P53708 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA8P53708 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA8P53708 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA8P53708 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA8P53708 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA8P53708 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA8P53708 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA8P53708 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA8P53708 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA8P53708 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA8P53708 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA8P53708 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA8P53708 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA8P53708 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA8P53708 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA8P53708 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA8P53708 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA8P53708 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA8P53708 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA8P53708 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA8P53708 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA8P53708 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA8P53708 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA8P53708 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA8P53708 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA8P53708 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA8P53708 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
ITGA8P53708 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGA8P53708 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGA8P53708 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGA8P53708 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGA8P53708 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGA8P53708 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms