Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FOSBP53539 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FOSBP53539 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FOSBP53539 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FOSBP53539 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FOSBP53539 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FOSBP53539 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FOSBP53539 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FOSBP53539 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
FOSBP53539 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FOSBP53539 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FOSBP53539 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FOSBP53539 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FOSBP53539 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FOSBP53539 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FOSBP53539 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
FOSBP53539 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
FOSBP53539 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FOSBP53539 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FOSBP53539 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FOSBP53539 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOSBP53539 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOSBP53539 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOSBP53539 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOSBP53539 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOSBP53539 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOSBP53539 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOSBP53539 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOSBP53539 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOSBP53539 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOSBP53539 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOSBP53539 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOSBP53539 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FOSBP53539 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FOSBP53539 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FOSBP53539 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FOSBP53539 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FOSBP53539 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
FOSBP53539 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25■■□□□ 1.59
FOSBP53539 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FOSBP53539 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
FOSBP53539 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
FOSBP53539 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FOSBP53539 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FOSBP53539 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FOSBP53539 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FOSBP53539 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FOSBP53539 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FOSBP53539 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FOSBP53539 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FOSBP53539 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FOSBP53539 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FOSBP53539 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FOSBP53539 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FOSBP53539 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FOSBP53539 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FOSBP53539 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
FOSBP53539 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FOSBP53539 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FOSBP53539 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOSBP53539 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOSBP53539 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOSBP53539 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOSBP53539 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOSBP53539 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOSBP53539 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FOSBP53539 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FOSBP53539 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FOSBP53539 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FOSBP53539 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FOSBP53539 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FOSBP53539 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FOSBP53539 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FOSBP53539 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FOSBP53539 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FOSBP53539 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FOSBP53539 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FOSBP53539 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FOSBP53539 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
FOSBP53539 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOSBP53539 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOSBP53539 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOSBP53539 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOSBP53539 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOSBP53539 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOSBP53539 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOSBP53539 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOSBP53539 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOSBP53539 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOSBP53539 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOSBP53539 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOSBP53539 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOSBP53539 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOSBP53539 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOSBP53539 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOSBP53539 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOSBP53539 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
FOSBP53539 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOSBP53539 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
FOSBP53539 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms