Protein–RNA interactions for Protein: P51170

SCNN1G, Amiloride-sensitive sodium channel subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNN1GP51170 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCNN1GP51170 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCNN1GP51170 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCNN1GP51170 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCNN1GP51170 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCNN1GP51170 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCNN1GP51170 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCNN1GP51170 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCNN1GP51170 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCNN1GP51170 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SCNN1GP51170 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCNN1GP51170 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCNN1GP51170 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCNN1GP51170 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCNN1GP51170 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCNN1GP51170 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCNN1GP51170 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCNN1GP51170 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCNN1GP51170 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCNN1GP51170 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCNN1GP51170 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCNN1GP51170 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCNN1GP51170 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCNN1GP51170 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCNN1GP51170 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCNN1GP51170 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCNN1GP51170 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCNN1GP51170 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCNN1GP51170 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCNN1GP51170 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCNN1GP51170 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCNN1GP51170 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCNN1GP51170 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCNN1GP51170 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCNN1GP51170 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SCNN1GP51170 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCNN1GP51170 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCNN1GP51170 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SCNN1GP51170 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCNN1GP51170 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCNN1GP51170 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCNN1GP51170 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCNN1GP51170 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCNN1GP51170 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCNN1GP51170 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCNN1GP51170 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCNN1GP51170 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCNN1GP51170 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCNN1GP51170 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCNN1GP51170 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCNN1GP51170 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCNN1GP51170 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCNN1GP51170 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCNN1GP51170 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCNN1GP51170 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCNN1GP51170 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCNN1GP51170 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCNN1GP51170 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCNN1GP51170 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCNN1GP51170 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCNN1GP51170 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCNN1GP51170 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCNN1GP51170 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCNN1GP51170 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCNN1GP51170 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SCNN1GP51170 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SCNN1GP51170 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCNN1GP51170 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCNN1GP51170 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCNN1GP51170 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCNN1GP51170 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCNN1GP51170 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCNN1GP51170 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCNN1GP51170 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCNN1GP51170 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCNN1GP51170 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCNN1GP51170 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCNN1GP51170 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCNN1GP51170 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCNN1GP51170 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SCNN1GP51170 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCNN1GP51170 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SCNN1GP51170 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCNN1GP51170 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SCNN1GP51170 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCNN1GP51170 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCNN1GP51170 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCNN1GP51170 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SCNN1GP51170 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SCNN1GP51170 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SCNN1GP51170 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SCNN1GP51170 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SCNN1GP51170 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCNN1GP51170 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCNN1GP51170 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCNN1GP51170 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCNN1GP51170 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCNN1GP51170 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCNN1GP51170 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCNN1GP51170 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms