Protein–RNA interactions for Protein: P50993

ATP1A2, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A2P50993 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP1A2P50993 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP1A2P50993 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP1A2P50993 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP1A2P50993 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP1A2P50993 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP1A2P50993 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP1A2P50993 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP1A2P50993 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP1A2P50993 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP1A2P50993 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP1A2P50993 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP1A2P50993 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP1A2P50993 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP1A2P50993 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP1A2P50993 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP1A2P50993 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP1A2P50993 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP1A2P50993 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP1A2P50993 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP1A2P50993 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP1A2P50993 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP1A2P50993 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP1A2P50993 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP1A2P50993 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP1A2P50993 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP1A2P50993 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP1A2P50993 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP1A2P50993 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP1A2P50993 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP1A2P50993 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP1A2P50993 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP1A2P50993 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP1A2P50993 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP1A2P50993 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP1A2P50993 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP1A2P50993 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP1A2P50993 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP1A2P50993 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP1A2P50993 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP1A2P50993 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP1A2P50993 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP1A2P50993 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP1A2P50993 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP1A2P50993 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP1A2P50993 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP1A2P50993 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP1A2P50993 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP1A2P50993 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP1A2P50993 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP1A2P50993 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP1A2P50993 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP1A2P50993 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP1A2P50993 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP1A2P50993 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP1A2P50993 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP1A2P50993 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP1A2P50993 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP1A2P50993 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP1A2P50993 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP1A2P50993 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP1A2P50993 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP1A2P50993 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP1A2P50993 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP1A2P50993 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP1A2P50993 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP1A2P50993 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP1A2P50993 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP1A2P50993 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP1A2P50993 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP1A2P50993 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP1A2P50993 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP1A2P50993 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP1A2P50993 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP1A2P50993 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP1A2P50993 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP1A2P50993 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP1A2P50993 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP1A2P50993 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP1A2P50993 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP1A2P50993 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP1A2P50993 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP1A2P50993 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP1A2P50993 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP1A2P50993 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP1A2P50993 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP1A2P50993 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP1A2P50993 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP1A2P50993 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP1A2P50993 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP1A2P50993 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP1A2P50993 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP1A2P50993 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP1A2P50993 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP1A2P50993 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP1A2P50993 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP1A2P50993 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP1A2P50993 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP1A2P50993 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP1A2P50993 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms