Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MDH1P40925 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MDH1P40925 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MDH1P40925 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MDH1P40925 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MDH1P40925 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MDH1P40925 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MDH1P40925 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MDH1P40925 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MDH1P40925 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MDH1P40925 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MDH1P40925 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MDH1P40925 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MDH1P40925 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MDH1P40925 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MDH1P40925 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MDH1P40925 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
MDH1P40925 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MDH1P40925 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MDH1P40925 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MDH1P40925 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MDH1P40925 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MDH1P40925 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MDH1P40925 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MDH1P40925 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MDH1P40925 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MDH1P40925 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MDH1P40925 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MDH1P40925 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MDH1P40925 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MDH1P40925 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MDH1P40925 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
MDH1P40925 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MDH1P40925 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MDH1P40925 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MDH1P40925 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MDH1P40925 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
MDH1P40925 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
MDH1P40925 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MDH1P40925 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MDH1P40925 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MDH1P40925 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MDH1P40925 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MDH1P40925 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MDH1P40925 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MDH1P40925 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MDH1P40925 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MDH1P40925 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MDH1P40925 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MDH1P40925 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
MDH1P40925 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MDH1P40925 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MDH1P40925 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MDH1P40925 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MDH1P40925 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MDH1P40925 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
MDH1P40925 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MDH1P40925 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MDH1P40925 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MDH1P40925 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MDH1P40925 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MDH1P40925 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MDH1P40925 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MDH1P40925 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MDH1P40925 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MDH1P40925 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MDH1P40925 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MDH1P40925 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MDH1P40925 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MDH1P40925 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MDH1P40925 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MDH1P40925 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MDH1P40925 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MDH1P40925 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MDH1P40925 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MDH1P40925 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MDH1P40925 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MDH1P40925 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MDH1P40925 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MDH1P40925 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MDH1P40925 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MDH1P40925 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MDH1P40925 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MDH1P40925 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MDH1P40925 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MDH1P40925 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MDH1P40925 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MDH1P40925 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MDH1P40925 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MDH1P40925 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MDH1P40925 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MDH1P40925 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MDH1P40925 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MDH1P40925 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MDH1P40925 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MDH1P40925 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MDH1P40925 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MDH1P40925 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MDH1P40925 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
MDH1P40925 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms