Protein–RNA interactions for Protein: P36578

RPL4, 60S ribosomal protein L4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL4P36578 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RPL4P36578 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RPL4P36578 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RPL4P36578 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RPL4P36578 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RPL4P36578 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
RPL4P36578 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RPL4P36578 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RPL4P36578 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RPL4P36578 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RPL4P36578 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RPL4P36578 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RPL4P36578 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RPL4P36578 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RPL4P36578 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RPL4P36578 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RPL4P36578 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RPL4P36578 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RPL4P36578 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RPL4P36578 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RPL4P36578 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RPL4P36578 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RPL4P36578 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RPL4P36578 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RPL4P36578 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RPL4P36578 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RPL4P36578 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RPL4P36578 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RPL4P36578 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RPL4P36578 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RPL4P36578 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
RPL4P36578 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RPL4P36578 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
RPL4P36578 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RPL4P36578 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RPL4P36578 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RPL4P36578 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RPL4P36578 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RPL4P36578 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RPL4P36578 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RPL4P36578 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RPL4P36578 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RPL4P36578 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RPL4P36578 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RPL4P36578 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RPL4P36578 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RPL4P36578 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RPL4P36578 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RPL4P36578 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RPL4P36578 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RPL4P36578 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RPL4P36578 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RPL4P36578 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RPL4P36578 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RPL4P36578 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RPL4P36578 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RPL4P36578 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RPL4P36578 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RPL4P36578 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RPL4P36578 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RPL4P36578 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
RPL4P36578 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RPL4P36578 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RPL4P36578 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RPL4P36578 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RPL4P36578 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RPL4P36578 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RPL4P36578 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RPL4P36578 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RPL4P36578 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RPL4P36578 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
RPL4P36578 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RPL4P36578 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RPL4P36578 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RPL4P36578 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RPL4P36578 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RPL4P36578 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RPL4P36578 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RPL4P36578 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RPL4P36578 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RPL4P36578 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
RPL4P36578 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RPL4P36578 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RPL4P36578 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
RPL4P36578 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
RPL4P36578 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RPL4P36578 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RPL4P36578 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RPL4P36578 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RPL4P36578 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RPL4P36578 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
RPL4P36578 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RPL4P36578 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RPL4P36578 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RPL4P36578 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RPL4P36578 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RPL4P36578 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RPL4P36578 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RPL4P36578 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RPL4P36578 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms