Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHI3L1P36222 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHI3L1P36222 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHI3L1P36222 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHI3L1P36222 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHI3L1P36222 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHI3L1P36222 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHI3L1P36222 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CHI3L1P36222 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHI3L1P36222 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHI3L1P36222 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHI3L1P36222 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHI3L1P36222 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHI3L1P36222 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CHI3L1P36222 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHI3L1P36222 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHI3L1P36222 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHI3L1P36222 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHI3L1P36222 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHI3L1P36222 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHI3L1P36222 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms