Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD12P35452 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD12P35452 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD12P35452 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD12P35452 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXD12P35452 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXD12P35452 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXD12P35452 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXD12P35452 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXD12P35452 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXD12P35452 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXD12P35452 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXD12P35452 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXD12P35452 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXD12P35452 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD12P35452 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD12P35452 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD12P35452 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD12P35452 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD12P35452 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD12P35452 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD12P35452 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD12P35452 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD12P35452 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD12P35452 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD12P35452 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD12P35452 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD12P35452 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD12P35452 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD12P35452 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD12P35452 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD12P35452 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD12P35452 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD12P35452 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD12P35452 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD12P35452 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD12P35452 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD12P35452 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD12P35452 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD12P35452 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD12P35452 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD12P35452 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HOXD12P35452 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HOXD12P35452 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HOXD12P35452 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HOXD12P35452 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXD12P35452 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXD12P35452 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXD12P35452 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXD12P35452 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXD12P35452 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXD12P35452 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXD12P35452 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXD12P35452 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXD12P35452 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXD12P35452 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXD12P35452 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXD12P35452 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXD12P35452 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXD12P35452 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXD12P35452 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD12P35452 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD12P35452 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD12P35452 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD12P35452 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD12P35452 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD12P35452 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD12P35452 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD12P35452 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD12P35452 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD12P35452 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD12P35452 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD12P35452 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD12P35452 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD12P35452 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD12P35452 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD12P35452 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD12P35452 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD12P35452 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD12P35452 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD12P35452 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD12P35452 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD12P35452 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD12P35452 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD12P35452 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD12P35452 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD12P35452 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD12P35452 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD12P35452 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD12P35452 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD12P35452 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD12P35452 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXD12P35452 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXD12P35452 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXD12P35452 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXD12P35452 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXD12P35452 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXD12P35452 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXD12P35452 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXD12P35452 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms