Protein–RNA interactions for Protein: P35250

RFC2, Replication factor C subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC2P35250 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RFC2P35250 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFC2P35250 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFC2P35250 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFC2P35250 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFC2P35250 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFC2P35250 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFC2P35250 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFC2P35250 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFC2P35250 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RFC2P35250 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFC2P35250 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFC2P35250 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RFC2P35250 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFC2P35250 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFC2P35250 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RFC2P35250 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFC2P35250 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFC2P35250 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFC2P35250 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFC2P35250 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFC2P35250 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFC2P35250 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFC2P35250 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFC2P35250 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RFC2P35250 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFC2P35250 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFC2P35250 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFC2P35250 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFC2P35250 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFC2P35250 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFC2P35250 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFC2P35250 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFC2P35250 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFC2P35250 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFC2P35250 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RFC2P35250 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RFC2P35250 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFC2P35250 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFC2P35250 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFC2P35250 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFC2P35250 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFC2P35250 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFC2P35250 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFC2P35250 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFC2P35250 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFC2P35250 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFC2P35250 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFC2P35250 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFC2P35250 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFC2P35250 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFC2P35250 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFC2P35250 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFC2P35250 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFC2P35250 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFC2P35250 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFC2P35250 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFC2P35250 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFC2P35250 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFC2P35250 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFC2P35250 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFC2P35250 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFC2P35250 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFC2P35250 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFC2P35250 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFC2P35250 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFC2P35250 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFC2P35250 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFC2P35250 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFC2P35250 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RFC2P35250 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFC2P35250 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFC2P35250 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFC2P35250 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFC2P35250 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFC2P35250 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFC2P35250 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RFC2P35250 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFC2P35250 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFC2P35250 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFC2P35250 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFC2P35250 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFC2P35250 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFC2P35250 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFC2P35250 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFC2P35250 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFC2P35250 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFC2P35250 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFC2P35250 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFC2P35250 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFC2P35250 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFC2P35250 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFC2P35250 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFC2P35250 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RFC2P35250 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RFC2P35250 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RFC2P35250 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RFC2P35250 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RFC2P35250 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RFC2P35250 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms