Protein–RNA interactions for Protein: P32302

CXCR5, C-X-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR5P32302 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CXCR5P32302 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CXCR5P32302 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CXCR5P32302 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CXCR5P32302 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CXCR5P32302 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CXCR5P32302 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CXCR5P32302 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CXCR5P32302 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CXCR5P32302 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CXCR5P32302 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CXCR5P32302 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CXCR5P32302 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CXCR5P32302 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CXCR5P32302 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CXCR5P32302 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CXCR5P32302 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CXCR5P32302 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CXCR5P32302 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CXCR5P32302 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CXCR5P32302 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CXCR5P32302 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CXCR5P32302 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CXCR5P32302 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CXCR5P32302 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CXCR5P32302 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CXCR5P32302 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CXCR5P32302 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CXCR5P32302 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CXCR5P32302 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CXCR5P32302 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CXCR5P32302 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CXCR5P32302 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CXCR5P32302 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CXCR5P32302 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CXCR5P32302 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CXCR5P32302 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CXCR5P32302 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CXCR5P32302 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CXCR5P32302 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CXCR5P32302 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CXCR5P32302 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CXCR5P32302 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CXCR5P32302 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CXCR5P32302 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CXCR5P32302 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CXCR5P32302 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CXCR5P32302 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CXCR5P32302 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CXCR5P32302 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CXCR5P32302 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CXCR5P32302 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CXCR5P32302 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CXCR5P32302 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CXCR5P32302 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CXCR5P32302 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CXCR5P32302 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CXCR5P32302 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CXCR5P32302 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CXCR5P32302 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CXCR5P32302 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CXCR5P32302 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CXCR5P32302 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CXCR5P32302 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CXCR5P32302 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CXCR5P32302 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CXCR5P32302 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CXCR5P32302 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CXCR5P32302 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CXCR5P32302 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CXCR5P32302 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CXCR5P32302 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CXCR5P32302 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CXCR5P32302 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CXCR5P32302 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CXCR5P32302 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CXCR5P32302 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CXCR5P32302 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CXCR5P32302 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CXCR5P32302 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CXCR5P32302 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CXCR5P32302 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CXCR5P32302 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CXCR5P32302 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CXCR5P32302 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CXCR5P32302 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CXCR5P32302 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CXCR5P32302 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CXCR5P32302 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CXCR5P32302 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CXCR5P32302 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CXCR5P32302 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CXCR5P32302 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CXCR5P32302 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CXCR5P32302 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CXCR5P32302 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CXCR5P32302 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CXCR5P32302 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CXCR5P32302 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CXCR5P32302 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms