Protein–RNA interactions for Protein: P29966

MARCKS, Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSP29966 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MARCKSP29966 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MARCKSP29966 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MARCKSP29966 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MARCKSP29966 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MARCKSP29966 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MARCKSP29966 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MARCKSP29966 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MARCKSP29966 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MARCKSP29966 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MARCKSP29966 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MARCKSP29966 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MARCKSP29966 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MARCKSP29966 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MARCKSP29966 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MARCKSP29966 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MARCKSP29966 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MARCKSP29966 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MARCKSP29966 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MARCKSP29966 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MARCKSP29966 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MARCKSP29966 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MARCKSP29966 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MARCKSP29966 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MARCKSP29966 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MARCKSP29966 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MARCKSP29966 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MARCKSP29966 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MARCKSP29966 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MARCKSP29966 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MARCKSP29966 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MARCKSP29966 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
MARCKSP29966 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
MARCKSP29966 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MARCKSP29966 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MARCKSP29966 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MARCKSP29966 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MARCKSP29966 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MARCKSP29966 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MARCKSP29966 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MARCKSP29966 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MARCKSP29966 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MARCKSP29966 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MARCKSP29966 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MARCKSP29966 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MARCKSP29966 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MARCKSP29966 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MARCKSP29966 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MARCKSP29966 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MARCKSP29966 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MARCKSP29966 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MARCKSP29966 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MARCKSP29966 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MARCKSP29966 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
MARCKSP29966 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MARCKSP29966 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MARCKSP29966 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MARCKSP29966 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MARCKSP29966 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MARCKSP29966 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MARCKSP29966 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MARCKSP29966 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MARCKSP29966 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MARCKSP29966 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MARCKSP29966 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MARCKSP29966 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MARCKSP29966 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MARCKSP29966 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MARCKSP29966 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MARCKSP29966 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MARCKSP29966 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MARCKSP29966 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MARCKSP29966 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MARCKSP29966 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MARCKSP29966 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MARCKSP29966 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MARCKSP29966 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MARCKSP29966 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MARCKSP29966 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MARCKSP29966 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MARCKSP29966 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MARCKSP29966 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MARCKSP29966 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MARCKSP29966 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MARCKSP29966 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MARCKSP29966 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MARCKSP29966 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MARCKSP29966 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MARCKSP29966 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MARCKSP29966 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MARCKSP29966 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MARCKSP29966 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MARCKSP29966 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MARCKSP29966 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MARCKSP29966 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MARCKSP29966 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MARCKSP29966 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MARCKSP29966 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MARCKSP29966 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MARCKSP29966 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms