Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRDP23468 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRDP23468 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRDP23468 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRDP23468 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRDP23468 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRDP23468 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRDP23468 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRDP23468 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRDP23468 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRDP23468 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRDP23468 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRDP23468 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRDP23468 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRDP23468 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRDP23468 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRDP23468 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRDP23468 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRDP23468 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRDP23468 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRDP23468 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRDP23468 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRDP23468 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRDP23468 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRDP23468 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRDP23468 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRDP23468 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRDP23468 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRDP23468 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRDP23468 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRDP23468 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRDP23468 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPRDP23468 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPRDP23468 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPRDP23468 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPRDP23468 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPRDP23468 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRDP23468 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRDP23468 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRDP23468 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRDP23468 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRDP23468 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRDP23468 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRDP23468 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRDP23468 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRDP23468 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRDP23468 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRDP23468 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRDP23468 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRDP23468 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRDP23468 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRDP23468 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRDP23468 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRDP23468 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRDP23468 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRDP23468 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRDP23468 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRDP23468 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRDP23468 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRDP23468 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRDP23468 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRDP23468 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRDP23468 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRDP23468 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRDP23468 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRDP23468 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRDP23468 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRDP23468 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRDP23468 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRDP23468 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRDP23468 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRDP23468 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRDP23468 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRDP23468 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRDP23468 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRDP23468 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRDP23468 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRDP23468 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRDP23468 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRDP23468 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRDP23468 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRDP23468 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRDP23468 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRDP23468 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRDP23468 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRDP23468 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRDP23468 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRDP23468 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRDP23468 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRDP23468 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRDP23468 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRDP23468 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRDP23468 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRDP23468 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRDP23468 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRDP23468 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRDP23468 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRDP23468 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRDP23468 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRDP23468 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms