Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GCSHP23434 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GCSHP23434 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GCSHP23434 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GCSHP23434 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GCSHP23434 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GCSHP23434 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GCSHP23434 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GCSHP23434 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GCSHP23434 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GCSHP23434 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GCSHP23434 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GCSHP23434 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GCSHP23434 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GCSHP23434 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GCSHP23434 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GCSHP23434 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GCSHP23434 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GCSHP23434 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GCSHP23434 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GCSHP23434 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GCSHP23434 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GCSHP23434 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GCSHP23434 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCSHP23434 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCSHP23434 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCSHP23434 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCSHP23434 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCSHP23434 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCSHP23434 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCSHP23434 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCSHP23434 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCSHP23434 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GCSHP23434 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCSHP23434 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCSHP23434 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCSHP23434 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCSHP23434 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCSHP23434 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCSHP23434 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCSHP23434 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCSHP23434 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCSHP23434 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCSHP23434 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCSHP23434 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCSHP23434 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCSHP23434 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCSHP23434 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCSHP23434 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCSHP23434 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCSHP23434 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCSHP23434 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCSHP23434 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCSHP23434 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCSHP23434 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCSHP23434 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCSHP23434 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCSHP23434 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCSHP23434 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCSHP23434 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCSHP23434 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCSHP23434 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCSHP23434 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCSHP23434 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCSHP23434 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCSHP23434 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCSHP23434 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCSHP23434 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCSHP23434 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCSHP23434 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCSHP23434 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCSHP23434 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCSHP23434 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCSHP23434 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCSHP23434 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCSHP23434 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GCSHP23434 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCSHP23434 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCSHP23434 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCSHP23434 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCSHP23434 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCSHP23434 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCSHP23434 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCSHP23434 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GCSHP23434 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCSHP23434 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCSHP23434 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GCSHP23434 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCSHP23434 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GCSHP23434 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCSHP23434 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCSHP23434 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCSHP23434 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCSHP23434 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCSHP23434 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCSHP23434 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GCSHP23434 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCSHP23434 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCSHP23434 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCSHP23434 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms