Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
HRCP23327 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
HRCP23327 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
HRCP23327 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
HRCP23327 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
HRCP23327 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
HRCP23327 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
HRCP23327 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
HRCP23327 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC33.25■■■□□ 2.91
HRCP23327 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
HRCP23327 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
HRCP23327 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
HRCP23327 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
HRCP23327 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
HRCP23327 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
HRCP23327 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
HRCP23327 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
HRCP23327 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
HRCP23327 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
HRCP23327 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
HRCP23327 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
HRCP23327 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
HRCP23327 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
HRCP23327 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
HRCP23327 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
HRCP23327 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
HRCP23327 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
HRCP23327 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
HRCP23327 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
HRCP23327 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
HRCP23327 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC33.22■■■□□ 2.91
HRCP23327 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
HRCP23327 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
HRCP23327 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
HRCP23327 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
HRCP23327 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
HRCP23327 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
HRCP23327 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
HRCP23327 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
HRCP23327 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
HRCP23327 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
HRCP23327 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
HRCP23327 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
HRCP23327 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
HRCP23327 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC33.21■■■□□ 2.91
HRCP23327 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
HRCP23327 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
HRCP23327 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
HRCP23327 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
HRCP23327 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
HRCP23327 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
HRCP23327 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
HRCP23327 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
HRCP23327 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
HRCP23327 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
HRCP23327 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC33.2■■■□□ 2.91
HRCP23327 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
HRCP23327 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
HRCP23327 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
HRCP23327 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
HRCP23327 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
HRCP23327 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
HRCP23327 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
HRCP23327 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
HRCP23327 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
HRCP23327 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC33.2■■■□□ 2.9
HRCP23327 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC33.2■■■□□ 2.9
HRCP23327 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
HRCP23327 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
HRCP23327 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
HRCP23327 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
HRCP23327 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
HRCP23327 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
HRCP23327 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
HRCP23327 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
HRCP23327 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
HRCP23327 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
HRCP23327 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
HRCP23327 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
HRCP23327 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
HRCP23327 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
HRCP23327 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
HRCP23327 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
HRCP23327 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
HRCP23327 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
HRCP23327 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
HRCP23327 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
HRCP23327 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
HRCP23327 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
HRCP23327 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
HRCP23327 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
HRCP23327 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
HRCP23327 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
HRCP23327 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
HRCP23327 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
HRCP23327 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
HRCP23327 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
HRCP23327 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC33.16■■■□□ 2.9
HRCP23327 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
HRCP23327 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms