Protein–RNA interactions for Protein: P16949

STMN1, Stathmin, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STMN1P16949 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
STMN1P16949 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
STMN1P16949 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
STMN1P16949 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
STMN1P16949 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
STMN1P16949 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
STMN1P16949 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
STMN1P16949 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
STMN1P16949 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
STMN1P16949 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
STMN1P16949 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
STMN1P16949 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
STMN1P16949 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
STMN1P16949 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
STMN1P16949 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
STMN1P16949 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
STMN1P16949 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
STMN1P16949 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
STMN1P16949 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
STMN1P16949 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
STMN1P16949 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
STMN1P16949 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
STMN1P16949 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
STMN1P16949 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
STMN1P16949 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
STMN1P16949 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
STMN1P16949 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
STMN1P16949 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
STMN1P16949 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
STMN1P16949 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
STMN1P16949 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
STMN1P16949 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
STMN1P16949 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
STMN1P16949 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
STMN1P16949 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
STMN1P16949 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
STMN1P16949 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
STMN1P16949 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
STMN1P16949 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
STMN1P16949 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
STMN1P16949 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
STMN1P16949 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
STMN1P16949 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
STMN1P16949 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
STMN1P16949 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
STMN1P16949 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
STMN1P16949 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
STMN1P16949 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
STMN1P16949 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
STMN1P16949 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
STMN1P16949 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
STMN1P16949 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
STMN1P16949 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
STMN1P16949 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
STMN1P16949 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
STMN1P16949 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
STMN1P16949 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
STMN1P16949 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
STMN1P16949 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
STMN1P16949 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
STMN1P16949 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
STMN1P16949 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
STMN1P16949 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
STMN1P16949 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
STMN1P16949 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
STMN1P16949 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
STMN1P16949 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
STMN1P16949 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
STMN1P16949 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
STMN1P16949 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
STMN1P16949 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
STMN1P16949 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
STMN1P16949 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
STMN1P16949 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
STMN1P16949 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
STMN1P16949 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
STMN1P16949 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
STMN1P16949 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
STMN1P16949 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
STMN1P16949 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
STMN1P16949 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
STMN1P16949 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
STMN1P16949 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
STMN1P16949 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
STMN1P16949 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
STMN1P16949 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
STMN1P16949 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
STMN1P16949 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
STMN1P16949 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
STMN1P16949 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
STMN1P16949 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
STMN1P16949 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
STMN1P16949 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
STMN1P16949 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
STMN1P16949 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
STMN1P16949 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
STMN1P16949 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
STMN1P16949 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
STMN1P16949 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
STMN1P16949 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms