Protein–RNA interactions for Protein: P15923

TCF3, Transcription factor E2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF3P15923 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCF3P15923 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCF3P15923 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCF3P15923 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCF3P15923 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCF3P15923 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TCF3P15923 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCF3P15923 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCF3P15923 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TCF3P15923 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCF3P15923 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TCF3P15923 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TCF3P15923 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCF3P15923 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCF3P15923 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCF3P15923 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCF3P15923 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCF3P15923 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCF3P15923 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCF3P15923 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCF3P15923 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TCF3P15923 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCF3P15923 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCF3P15923 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCF3P15923 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCF3P15923 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCF3P15923 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCF3P15923 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCF3P15923 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TCF3P15923 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCF3P15923 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCF3P15923 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCF3P15923 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCF3P15923 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCF3P15923 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCF3P15923 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCF3P15923 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCF3P15923 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCF3P15923 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCF3P15923 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCF3P15923 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCF3P15923 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCF3P15923 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCF3P15923 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCF3P15923 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCF3P15923 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TCF3P15923 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCF3P15923 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCF3P15923 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCF3P15923 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCF3P15923 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCF3P15923 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCF3P15923 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCF3P15923 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCF3P15923 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCF3P15923 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TCF3P15923 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCF3P15923 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCF3P15923 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCF3P15923 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCF3P15923 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCF3P15923 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCF3P15923 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCF3P15923 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCF3P15923 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCF3P15923 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCF3P15923 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCF3P15923 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCF3P15923 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCF3P15923 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCF3P15923 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCF3P15923 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCF3P15923 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCF3P15923 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCF3P15923 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCF3P15923 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCF3P15923 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TCF3P15923 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TCF3P15923 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCF3P15923 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TCF3P15923 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCF3P15923 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCF3P15923 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCF3P15923 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCF3P15923 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCF3P15923 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCF3P15923 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TCF3P15923 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCF3P15923 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCF3P15923 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCF3P15923 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TCF3P15923 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCF3P15923 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCF3P15923 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCF3P15923 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCF3P15923 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TCF3P15923 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCF3P15923 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCF3P15923 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCF3P15923 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms