Protein–RNA interactions for Protein: P13984

GTF2F2, General transcription factor IIF subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F2P13984 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2F2P13984 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2F2P13984 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2F2P13984 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2F2P13984 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2F2P13984 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2F2P13984 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2F2P13984 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2F2P13984 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2F2P13984 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2F2P13984 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2F2P13984 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GTF2F2P13984 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GTF2F2P13984 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GTF2F2P13984 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GTF2F2P13984 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GTF2F2P13984 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GTF2F2P13984 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2F2P13984 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2F2P13984 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2F2P13984 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2F2P13984 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2F2P13984 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2F2P13984 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2F2P13984 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2F2P13984 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2F2P13984 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2F2P13984 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2F2P13984 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2F2P13984 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2F2P13984 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2F2P13984 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2F2P13984 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2F2P13984 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2F2P13984 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2F2P13984 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2F2P13984 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2F2P13984 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2F2P13984 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2F2P13984 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2F2P13984 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2F2P13984 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2F2P13984 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2F2P13984 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2F2P13984 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2F2P13984 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2F2P13984 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2F2P13984 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2F2P13984 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2F2P13984 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2F2P13984 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2F2P13984 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2F2P13984 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2F2P13984 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2F2P13984 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2F2P13984 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2F2P13984 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2F2P13984 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2F2P13984 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2F2P13984 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2F2P13984 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2F2P13984 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2F2P13984 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2F2P13984 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2F2P13984 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2F2P13984 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2F2P13984 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2F2P13984 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2F2P13984 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2F2P13984 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2F2P13984 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2F2P13984 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2F2P13984 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2F2P13984 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2F2P13984 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2F2P13984 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2F2P13984 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2F2P13984 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2F2P13984 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2F2P13984 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2F2P13984 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2F2P13984 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2F2P13984 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2F2P13984 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2F2P13984 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2F2P13984 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2F2P13984 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2F2P13984 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2F2P13984 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2F2P13984 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2F2P13984 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2F2P13984 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2F2P13984 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2F2P13984 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2F2P13984 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2F2P13984 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2F2P13984 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2F2P13984 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2F2P13984 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2F2P13984 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms