Protein–RNA interactions for Protein: P13861

PRKAR2A, cAMP-dependent protein kinase type II-alpha regulatory subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAR2AP13861 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKAR2AP13861 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKAR2AP13861 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKAR2AP13861 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKAR2AP13861 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKAR2AP13861 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKAR2AP13861 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKAR2AP13861 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKAR2AP13861 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKAR2AP13861 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKAR2AP13861 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKAR2AP13861 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKAR2AP13861 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKAR2AP13861 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKAR2AP13861 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKAR2AP13861 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKAR2AP13861 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKAR2AP13861 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKAR2AP13861 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKAR2AP13861 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKAR2AP13861 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKAR2AP13861 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKAR2AP13861 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKAR2AP13861 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKAR2AP13861 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKAR2AP13861 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKAR2AP13861 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKAR2AP13861 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKAR2AP13861 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKAR2AP13861 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKAR2AP13861 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKAR2AP13861 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKAR2AP13861 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKAR2AP13861 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKAR2AP13861 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKAR2AP13861 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKAR2AP13861 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKAR2AP13861 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKAR2AP13861 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKAR2AP13861 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKAR2AP13861 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKAR2AP13861 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKAR2AP13861 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKAR2AP13861 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKAR2AP13861 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKAR2AP13861 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKAR2AP13861 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKAR2AP13861 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKAR2AP13861 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKAR2AP13861 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKAR2AP13861 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKAR2AP13861 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKAR2AP13861 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKAR2AP13861 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKAR2AP13861 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKAR2AP13861 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKAR2AP13861 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKAR2AP13861 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKAR2AP13861 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKAR2AP13861 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKAR2AP13861 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKAR2AP13861 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKAR2AP13861 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKAR2AP13861 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKAR2AP13861 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKAR2AP13861 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKAR2AP13861 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKAR2AP13861 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKAR2AP13861 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKAR2AP13861 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKAR2AP13861 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKAR2AP13861 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKAR2AP13861 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKAR2AP13861 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKAR2AP13861 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKAR2AP13861 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKAR2AP13861 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKAR2AP13861 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKAR2AP13861 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKAR2AP13861 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKAR2AP13861 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKAR2AP13861 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKAR2AP13861 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKAR2AP13861 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKAR2AP13861 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKAR2AP13861 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKAR2AP13861 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKAR2AP13861 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKAR2AP13861 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKAR2AP13861 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKAR2AP13861 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKAR2AP13861 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKAR2AP13861 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKAR2AP13861 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKAR2AP13861 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKAR2AP13861 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKAR2AP13861 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKAR2AP13861 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKAR2AP13861 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKAR2AP13861 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms