Protein–RNA interactions for Protein: P10911

MCF2, Proto-oncogene DBL, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2P10911 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCF2P10911 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MCF2P10911 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCF2P10911 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCF2P10911 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCF2P10911 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCF2P10911 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCF2P10911 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCF2P10911 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCF2P10911 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCF2P10911 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCF2P10911 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MCF2P10911 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCF2P10911 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCF2P10911 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCF2P10911 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCF2P10911 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCF2P10911 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCF2P10911 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCF2P10911 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCF2P10911 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCF2P10911 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MCF2P10911 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCF2P10911 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCF2P10911 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCF2P10911 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MCF2P10911 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCF2P10911 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCF2P10911 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCF2P10911 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCF2P10911 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCF2P10911 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCF2P10911 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCF2P10911 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCF2P10911 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCF2P10911 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCF2P10911 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCF2P10911 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MCF2P10911 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCF2P10911 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCF2P10911 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCF2P10911 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCF2P10911 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MCF2P10911 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MCF2P10911 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MCF2P10911 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCF2P10911 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCF2P10911 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCF2P10911 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCF2P10911 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCF2P10911 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCF2P10911 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCF2P10911 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCF2P10911 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCF2P10911 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCF2P10911 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCF2P10911 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCF2P10911 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCF2P10911 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCF2P10911 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCF2P10911 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCF2P10911 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCF2P10911 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCF2P10911 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCF2P10911 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCF2P10911 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCF2P10911 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCF2P10911 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCF2P10911 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCF2P10911 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCF2P10911 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCF2P10911 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCF2P10911 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCF2P10911 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCF2P10911 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCF2P10911 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCF2P10911 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCF2P10911 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCF2P10911 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCF2P10911 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MCF2P10911 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCF2P10911 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCF2P10911 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCF2P10911 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCF2P10911 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCF2P10911 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCF2P10911 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCF2P10911 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MCF2P10911 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCF2P10911 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCF2P10911 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCF2P10911 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCF2P10911 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCF2P10911 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCF2P10911 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCF2P10911 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCF2P10911 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCF2P10911 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCF2P10911 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCF2P10911 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms