Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM228BP0C875 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM228BP0C875 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM228BP0C875 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM228BP0C875 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM228BP0C875 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM228BP0C875 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM228BP0C875 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM228BP0C875 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM228BP0C875 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM228BP0C875 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM228BP0C875 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM228BP0C875 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM228BP0C875 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM228BP0C875 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM228BP0C875 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM228BP0C875 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM228BP0C875 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM228BP0C875 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM228BP0C875 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM228BP0C875 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM228BP0C875 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM228BP0C875 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM228BP0C875 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM228BP0C875 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM228BP0C875 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM228BP0C875 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM228BP0C875 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM228BP0C875 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM228BP0C875 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM228BP0C875 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM228BP0C875 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM228BP0C875 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM228BP0C875 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM228BP0C875 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM228BP0C875 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM228BP0C875 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM228BP0C875 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM228BP0C875 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM228BP0C875 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM228BP0C875 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM228BP0C875 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM228BP0C875 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FAM228BP0C875 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FAM228BP0C875 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FAM228BP0C875 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM228BP0C875 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM228BP0C875 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM228BP0C875 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM228BP0C875 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM228BP0C875 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM228BP0C875 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM228BP0C875 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM228BP0C875 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM228BP0C875 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM228BP0C875 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM228BP0C875 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM228BP0C875 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM228BP0C875 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM228BP0C875 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM228BP0C875 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM228BP0C875 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM228BP0C875 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM228BP0C875 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM228BP0C875 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM228BP0C875 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM228BP0C875 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM228BP0C875 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM228BP0C875 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM228BP0C875 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM228BP0C875 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM228BP0C875 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM228BP0C875 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM228BP0C875 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM228BP0C875 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM228BP0C875 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM228BP0C875 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM228BP0C875 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM228BP0C875 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM228BP0C875 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM228BP0C875 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM228BP0C875 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM228BP0C875 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM228BP0C875 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM228BP0C875 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM228BP0C875 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM228BP0C875 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM228BP0C875 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM228BP0C875 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM228BP0C875 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM228BP0C875 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM228BP0C875 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM228BP0C875 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM228BP0C875 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM228BP0C875 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM228BP0C875 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM228BP0C875 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM228BP0C875 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM228BP0C875 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM228BP0C875 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms