Protein–RNA interactions for Protein: P09874

PARP1, Poly [ADP-ribose] polymerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP1P09874 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PARP1P09874 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PARP1P09874 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PARP1P09874 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PARP1P09874 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PARP1P09874 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PARP1P09874 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PARP1P09874 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PARP1P09874 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PARP1P09874 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PARP1P09874 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PARP1P09874 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PARP1P09874 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PARP1P09874 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PARP1P09874 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PARP1P09874 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PARP1P09874 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PARP1P09874 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PARP1P09874 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PARP1P09874 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PARP1P09874 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PARP1P09874 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PARP1P09874 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PARP1P09874 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PARP1P09874 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PARP1P09874 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PARP1P09874 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PARP1P09874 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PARP1P09874 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PARP1P09874 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PARP1P09874 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PARP1P09874 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PARP1P09874 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PARP1P09874 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PARP1P09874 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PARP1P09874 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PARP1P09874 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PARP1P09874 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PARP1P09874 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PARP1P09874 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PARP1P09874 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PARP1P09874 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PARP1P09874 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PARP1P09874 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PARP1P09874 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PARP1P09874 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PARP1P09874 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PARP1P09874 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PARP1P09874 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PARP1P09874 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PARP1P09874 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PARP1P09874 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PARP1P09874 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PARP1P09874 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PARP1P09874 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PARP1P09874 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PARP1P09874 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PARP1P09874 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PARP1P09874 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PARP1P09874 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PARP1P09874 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PARP1P09874 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PARP1P09874 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PARP1P09874 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PARP1P09874 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PARP1P09874 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PARP1P09874 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PARP1P09874 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PARP1P09874 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PARP1P09874 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PARP1P09874 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PARP1P09874 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PARP1P09874 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PARP1P09874 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PARP1P09874 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PARP1P09874 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PARP1P09874 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PARP1P09874 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PARP1P09874 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PARP1P09874 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PARP1P09874 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PARP1P09874 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PARP1P09874 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PARP1P09874 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PARP1P09874 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PARP1P09874 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PARP1P09874 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PARP1P09874 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PARP1P09874 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PARP1P09874 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PARP1P09874 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PARP1P09874 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PARP1P09874 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PARP1P09874 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PARP1P09874 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PARP1P09874 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PARP1P09874 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PARP1P09874 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PARP1P09874 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PARP1P09874 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms