Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
HSP90AB1P08238 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HSP90AB1P08238 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HSP90AB1P08238 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HSP90AB1P08238 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HSP90AB1P08238 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HSP90AB1P08238 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HSP90AB1P08238 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HSP90AB1P08238 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HSP90AB1P08238 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HSP90AB1P08238 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HSP90AB1P08238 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HSP90AB1P08238 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HSP90AB1P08238 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HSP90AB1P08238 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HSP90AB1P08238 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HSP90AB1P08238 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HSP90AB1P08238 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
HSP90AB1P08238 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HSP90AB1P08238 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HSP90AB1P08238 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HSP90AB1P08238 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HSP90AB1P08238 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HSP90AB1P08238 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HSP90AB1P08238 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
HSP90AB1P08238 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HSP90AB1P08238 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HSP90AB1P08238 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HSP90AB1P08238 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HSP90AB1P08238 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HSP90AB1P08238 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HSP90AB1P08238 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HSP90AB1P08238 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HSP90AB1P08238 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HSP90AB1P08238 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
HSP90AB1P08238 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HSP90AB1P08238 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
HSP90AB1P08238 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
HSP90AB1P08238 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
HSP90AB1P08238 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
HSP90AB1P08238 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HSP90AB1P08238 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
HSP90AB1P08238 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HSP90AB1P08238 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
HSP90AB1P08238 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HSP90AB1P08238 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HSP90AB1P08238 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HSP90AB1P08238 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HSP90AB1P08238 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HSP90AB1P08238 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HSP90AB1P08238 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HSP90AB1P08238 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HSP90AB1P08238 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HSP90AB1P08238 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HSP90AB1P08238 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HSP90AB1P08238 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HSP90AB1P08238 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HSP90AB1P08238 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HSP90AB1P08238 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
HSP90AB1P08238 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HSP90AB1P08238 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HSP90AB1P08238 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HSP90AB1P08238 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HSP90AB1P08238 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HSP90AB1P08238 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HSP90AB1P08238 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
HSP90AB1P08238 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
HSP90AB1P08238 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HSP90AB1P08238 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
HSP90AB1P08238 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HSP90AB1P08238 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HSP90AB1P08238 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
HSP90AB1P08238 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HSP90AB1P08238 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HSP90AB1P08238 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HSP90AB1P08238 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HSP90AB1P08238 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
HSP90AB1P08238 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
HSP90AB1P08238 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HSP90AB1P08238 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HSP90AB1P08238 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HSP90AB1P08238 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HSP90AB1P08238 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
HSP90AB1P08238 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HSP90AB1P08238 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HSP90AB1P08238 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HSP90AB1P08238 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HSP90AB1P08238 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HSP90AB1P08238 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HSP90AB1P08238 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HSP90AB1P08238 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HSP90AB1P08238 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HSP90AB1P08238 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HSP90AB1P08238 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HSP90AB1P08238 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HSP90AB1P08238 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HSP90AB1P08238 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HSP90AB1P08238 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HSP90AB1P08238 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HSP90AB1P08238 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms