Protein–RNA interactions for Protein: P01033

TIMP1, Metalloproteinase inhibitor 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMP1P01033 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TIMP1P01033 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TIMP1P01033 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TIMP1P01033 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TIMP1P01033 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TIMP1P01033 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TIMP1P01033 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TIMP1P01033 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TIMP1P01033 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TIMP1P01033 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TIMP1P01033 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TIMP1P01033 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TIMP1P01033 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TIMP1P01033 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TIMP1P01033 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TIMP1P01033 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TIMP1P01033 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TIMP1P01033 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TIMP1P01033 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TIMP1P01033 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TIMP1P01033 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TIMP1P01033 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TIMP1P01033 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TIMP1P01033 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TIMP1P01033 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TIMP1P01033 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TIMP1P01033 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TIMP1P01033 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TIMP1P01033 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TIMP1P01033 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TIMP1P01033 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TIMP1P01033 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TIMP1P01033 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TIMP1P01033 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TIMP1P01033 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TIMP1P01033 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TIMP1P01033 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TIMP1P01033 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TIMP1P01033 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TIMP1P01033 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TIMP1P01033 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TIMP1P01033 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TIMP1P01033 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TIMP1P01033 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TIMP1P01033 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TIMP1P01033 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TIMP1P01033 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TIMP1P01033 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TIMP1P01033 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TIMP1P01033 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TIMP1P01033 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TIMP1P01033 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TIMP1P01033 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TIMP1P01033 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TIMP1P01033 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TIMP1P01033 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TIMP1P01033 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TIMP1P01033 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TIMP1P01033 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TIMP1P01033 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TIMP1P01033 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TIMP1P01033 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TIMP1P01033 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TIMP1P01033 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TIMP1P01033 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TIMP1P01033 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TIMP1P01033 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TIMP1P01033 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TIMP1P01033 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TIMP1P01033 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TIMP1P01033 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TIMP1P01033 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TIMP1P01033 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TIMP1P01033 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TIMP1P01033 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TIMP1P01033 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TIMP1P01033 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TIMP1P01033 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TIMP1P01033 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TIMP1P01033 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TIMP1P01033 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TIMP1P01033 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TIMP1P01033 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TIMP1P01033 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TIMP1P01033 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TIMP1P01033 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TIMP1P01033 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TIMP1P01033 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TIMP1P01033 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TIMP1P01033 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TIMP1P01033 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TIMP1P01033 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TIMP1P01033 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TIMP1P01033 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TIMP1P01033 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TIMP1P01033 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TIMP1P01033 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TIMP1P01033 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TIMP1P01033 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TIMP1P01033 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms